23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene tRNA-Thr-3 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.0000131783  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0025  tRNA-Thr  90 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000411074  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0742  tRNA-Asn  100 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  hitchhiker  0.00204496  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1361  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0013  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0369049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0009  tRNA-Thr  86.27 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.630653 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0008  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0021  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.404313  normal  0.107554 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0037  tRNA-Phe  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000710934 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0035  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0047  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0061  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122342  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0009  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259067  hitchhiker  0.000000000126402 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0062  tRNA-Thr  86 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0050  tRNA-Thr  85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.111405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0025  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R22  tRNA-Thr  85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0247278  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0030  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0005  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.63313  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0275  tRNA-Thr  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000205711  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0037  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0388732 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0012  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000603563  normal  0.0893983 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t04  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.36184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>