26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_R0011 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_R0028  tRNA-Trp  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000261486  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0019  tRNA-Trp  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000281472  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0011  tRNA-Trp  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00579096  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0010  tRNA-Trp  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00799791 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0012  tRNA-Trp  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0019  tRNA-Trp  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00399304  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0004  tRNA-Trp  98.63 
 
 
73 bp  137  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0579339  normal  0.054785 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0003  tRNA-Trp  98.63 
 
 
73 bp  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0873546  normal  0.535822 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNATrpVIMSS1309351  tRNA-Trp  98.51 
 
 
73 bp  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.839325  normal  0.990685 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0044  tRNA-Trp  98.51 
 
 
73 bp  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0437713  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0026  tRNA-Trp  98.51 
 
 
73 bp  125  1e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0017  tRNA-Trp  98.51 
 
 
73 bp  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNATrpVIMSS1309265  tRNA-Trp  98.51 
 
 
73 bp  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNATrpVIMSS1309199  tRNA-Trp  98.51 
 
 
73 bp  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0988793 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNATrpVIMSS1309110  tRNA-Trp  98.51 
 
 
73 bp  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNATrpVIMSS1309154  tRNA-Trp  100 
 
 
73 bp  119  9e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0830816  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNATrpVIMSS1309078  tRNA-Trp  100 
 
 
73 bp  119  9e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0026  tRNA-Trp  97.01 
 
 
73 bp  117  3.9999999999999997e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0006  tRNA-Trp  86.15 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.576658  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0025  tRNA-Trp  87.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04751  hypothetical protein  96.67 
 
 
255 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.842794  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06811  hypothetical protein  96.67 
 
 
255 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0019  tRNA-Trp  90.24 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0117064  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0053  tRNA-Trp  87.76 
 
 
76 bp  50.1  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0372642  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0021  tRNA-Arg  96.43 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.610246  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07729  tRNA-Trp  86 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>