87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_R0025 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_R0025  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0053  tRNA-Trp  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0372642  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0564  tRNA-Trp  94.59 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198705  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNATrpVIMSS1309199  tRNA-Trp  87.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0988793 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0010  tRNA-Trp  87.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00799791 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0012  tRNA-Trp  87.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0009  tRNA-Trp  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.31538  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0008  tRNA-Trp  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0094  tRNA-Trp  87.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000000691551  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNATrpVIMSS1309078  tRNA-Trp  87.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNATrpVIMSS1309110  tRNA-Trp  87.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0019  tRNA-Trp  87.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000281472  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNATrpVIMSS1309265  tRNA-Trp  87.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNATrpVIMSS1309351  tRNA-Trp  87.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.839325  normal  0.990685 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0023  tRNA-Trp  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112621  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0044  tRNA-Trp  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000172694  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0008  tRNA-Trp  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNATrpVIMSS1309154  tRNA-Trp  87.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0830816  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0017  tRNA-Trp  87.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0019  tRNA-Trp  87.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00399304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0026  tRNA-Trp  87.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0011  tRNA-Trp  87.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00579096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0028  tRNA-Trp  87.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000261486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0044  tRNA-Trp  87.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0437713  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0028  tRNA-Trp  84 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00207734  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0016  tRNA-Trp  84 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0666862  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0071  tRNA-Trp  83.56 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0026  tRNA-Trp  87.76 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0012  tRNA-Trp  83.56 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.381785 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0019  tRNA-Trp  83.56 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14008  tRNA-Trp  83.56 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.030718 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0004  tRNA-Trp  87.76 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0579339  normal  0.054785 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0052  tRNA-Trp  83.56 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0048  tRNA-Trp  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0022  tRNA-Trp  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.362458  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0003  tRNA-Trp  87.76 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0873546  normal  0.535822 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_R0068  tRNA-Trp  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3761  tRNA-Trp  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000324341  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0012  tRNA-Trp  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00203559  normal  0.0113389 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0015  tRNA-Trp  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000139983  normal  0.133094 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0015  tRNA-Trp  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000191285  normal  0.40925 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0069  tRNA-Trp  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.053758  normal  0.217962 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0050  tRNA-Trp  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.601118 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0056  tRNA-Trp  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000539051  hitchhiker  0.00000061984 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0047  tRNA-Trp  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.401897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0019  tRNA-Trp  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0117064  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0060  tRNA-Trp  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.389804  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0042  tRNA-Trp  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0056  tRNA-Trp  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS04716  tRNA-Trp  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0715561 
 
 
-
 
NC_006055  Mflt028  tRNA-Trp  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.145529  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Trp-2  tRNA-Trp  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0176082  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0055  tRNA-Trp  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.062488  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3793  tRNA-Trp  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000169604  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0023  tRNA-Trp  96.3 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000236658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0008  tRNA-Trp  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000769382 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3083  tRNA-Trp  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000104905  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0076  tRNA-Trp  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000313217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3462  tRNA-Trp  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00200872  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0058  tRNA-Trp  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0567493  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0015  tRNA-Trp  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00484135  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0014  tRNA-Trp  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000157595  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3823  tRNA-Trp  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0925348  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Trp-1  tRNA-Trp  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0487653  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1907  tRNA-Trp  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000273718  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3185  tRNA-Trp  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000128551  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0013  tRNA-Trp  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0005  tRNA-Trp  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0009  tRNA-Trp  86.96 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0030  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0030  tRNA-Pro  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000233844  normal  0.0418304 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0037  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0065  tRNA-Trp  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.123802  normal  0.265717 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0028  tRNA-Trp  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0006  tRNA-Trp  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0021  tRNA-Trp  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0644  tRNA-Trp  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0060  tRNA-Trp  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0044  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0045  tRNA-Trp  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134628  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0047  tRNA-Trp  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000613865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0054  tRNA-Trp  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0055  tRNA-Trp  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0055  tRNA-Trp  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0044  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0033  tRNA-Trp  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.076955  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0057  tRNA-Trp  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00401705  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>