82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0644 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0644  tRNA-Trp  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Trp-1  tRNA-Trp  92.16 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000619868  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0024  tRNA-Trp  87.14 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0011  tRNA-Trp  90.57 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000961162  hitchhiker  0.00000879757 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0055  tRNA-Trp  92.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0045  tRNA-Trp  92.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134628  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tTrp01  tRNA-Trp  94.29 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0036  tRNA-Trp  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000784105  unclonable  0.0000000173687 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0028  tRNA-Trp  88.14 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00207734  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0013  tRNA-Trp  88 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00037699  normal  0.0920861 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0015  tRNA-Trp  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00484135  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0065  tRNA-Trp  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.123802  normal  0.265717 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3761  tRNA-Trp  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000324341  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3823  tRNA-Trp  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0925348  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0014  tRNA-Trp  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000157595  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0012  tRNA-Trp  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00203559  normal  0.0113389 
 
 
-
 
NC_003295  RS04716  tRNA-Trp  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0715561 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0015  tRNA-Trp  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000139983  normal  0.133094 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0055  tRNA-Trp  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0015  tRNA-Trp  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000191285  normal  0.40925 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0069  tRNA-Trp  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.053758  normal  0.217962 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0056  tRNA-Trp  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000539051  hitchhiker  0.00000061984 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0047  tRNA-Trp  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.401897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0060  tRNA-Trp  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.389804  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0050  tRNA-Trp  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.601118 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0021  tRNA-Trp  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394935  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3083  tRNA-Trp  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000104905  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0058  tRNA-Trp  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0567493  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0023  tRNA-Trp  92.11 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000236658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0076  tRNA-Trp  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000313217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0055  tRNA-Trp  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.062488  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0008  tRNA-Trp  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00647008 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3793  tRNA-Trp  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000169604  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0056  tRNA-Trp  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mflt028  tRNA-Trp  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.145529  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0056  tRNA-Trp  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0589076  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0017  tRNA-Trp  87.76 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119473 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0016  tRNA-Trp  87.76 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.825811  normal  0.984478 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0017  tRNA-Trp  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000589441  hitchhiker  0.00131035 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0034  tRNA-Trp  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0047  tRNA-Trp  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000613865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0130  tRNA-Trp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.108428  hitchhiker  0.00406594 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0006  tRNA-Trp  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0121  tRNA-Trp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000153016  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0021  tRNA-Trp  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t097  tRNA-Trp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000384434  normal  0.0126807 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0060  tRNA-Trp  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0005  tRNA-Trp  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0045  tRNA-Trp  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t013  tRNA-Trp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0106  tRNA-Trp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.375874  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0107  tRNA-Trp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000447975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0057  tRNA-Trp  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00401705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0031  tRNA-Trp  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0054  tRNA-Trp  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0030  tRNA-Trp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.327508  normal  0.923325 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0031  tRNA-Trp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.146866 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0028  tRNA-Trp  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0113  tRNA-Trp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0422602  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0047  tRNA-Trp  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0072652  decreased coverage  0.00838785 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0101  tRNA-Trp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0001896  normal  0.0160972 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0032  tRNA-Trp  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.648314  normal  0.932016 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Trp-2  tRNA-Trp  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0176082  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0025  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08670  tRNA-Trp  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000627266  hitchhiker  0.0000000142101 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0053  tRNA-Trp  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0372642  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0007  tRNA-Trp  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000241707  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0013  tRNA-Trp  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.635468  normal  0.0154478 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0067  tRNA-Trp  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000198819  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0048  tRNA-Trp  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0035  tRNA-Trp  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.349144  normal  0.230187 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0046  tRNA-Trp  88.1 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0013  tRNA-Trp  88.1 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000123102  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3185  tRNA-Trp  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000128551  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4298  tRNA-Trp  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.566506  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1907  tRNA-Trp  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000273718  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0011  tRNA-Trp  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0431964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0012  tRNA-Trp  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.714029  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3462  tRNA-Trp  89.47 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00200872  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0033  tRNA-Trp  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.076955  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0032  tRNA-Trp  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6002  tRNA-Trp  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>