298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_AR0037 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_AR0037  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0030  tRNA-Arg  97.18 
 
 
77 bp  125  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.103236  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0028  tRNA-Arg  97.18 
 
 
77 bp  125  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.110227  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RS01507  tRNA-Arg  97.18 
 
 
77 bp  125  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.0000000147856  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1961  tRNA-Arg  97.18 
 
 
77 bp  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.232967  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0032  tRNA-Arg  97.18 
 
 
77 bp  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.121216  normal  0.785903 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0028  tRNA-Arg  97.18 
 
 
77 bp  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00103992  normal  0.512029 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  97.18 
 
 
77 bp  125  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  97.18 
 
 
77 bp  125  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0819  tRNA-Arg  97.18 
 
 
77 bp  125  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0043  tRNA-Arg  97.18 
 
 
77 bp  125  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0173642  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0076  tRNA-Arg  97.18 
 
 
77 bp  125  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00038438  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2651  tRNA-Arg  97.18 
 
 
77 bp  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00638973  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3045  tRNA-Arg  97.18 
 
 
77 bp  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.020808  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3046  tRNA-Arg  97.18 
 
 
77 bp  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0395002  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0058  tRNA-Arg  97.18 
 
 
77 bp  125  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1589  tRNA-Arg  97.18 
 
 
77 bp  125  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00193926  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1590  tRNA-Arg  97.18 
 
 
77 bp  125  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000176536  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0009  tRNA-Arg  97.18 
 
 
77 bp  125  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0136864  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0081  tRNA-Arg  97.18 
 
 
77 bp  125  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120582  normal  0.0141805 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0011  tRNA-Arg  97.18 
 
 
77 bp  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00226838  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0012  tRNA-Arg  97.18 
 
 
77 bp  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00501497  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0013  tRNA-Arg  97.18 
 
 
77 bp  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0010358  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0030  tRNA-Arg  97.18 
 
 
77 bp  125  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0479524  normal  0.8526 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0031  tRNA-Arg  97.18 
 
 
77 bp  125  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0292671  normal  0.864836 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0818  tRNA-Arg  97.18 
 
 
77 bp  125  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1960  tRNA-Arg  97.18 
 
 
77 bp  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.158848  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0056  tRNA-Arg  97.18 
 
 
77 bp  125  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0057  tRNA-Arg  97.18 
 
 
77 bp  125  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2652  tRNA-Arg  97.18 
 
 
77 bp  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0122696  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0029  tRNA-Arg  97.18 
 
 
77 bp  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00109449  normal  0.51543 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0028  tRNA-Arg  97.18 
 
 
77 bp  125  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000191779  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0029  tRNA-Arg  97.18 
 
 
77 bp  125  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000599175  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0030  tRNA-Arg  97.18 
 
 
77 bp  125  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000599175  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2946  tRNA-Arg  97.18 
 
 
77 bp  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0142864  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2945  tRNA-Arg  97.18 
 
 
77 bp  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0156149  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0027  tRNA-Arg  97.18 
 
 
77 bp  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0248505  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0028  tRNA-Arg  97.18 
 
 
77 bp  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00884611  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0029  tRNA-Arg  97.18 
 
 
77 bp  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00243187  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0029  tRNA-Arg  97.18 
 
 
77 bp  125  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.102871  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0036  tRNA-Arg  97.18 
 
 
77 bp  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0602741  normal  0.052924 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0030  tRNA-Arg  97.18 
 
 
77 bp  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000476466  normal  0.507447 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3012  tRNA-Arg  97.18 
 
 
77 bp  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.686481  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3011  tRNA-Arg  97.18 
 
 
77 bp  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.437147  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0043  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0103338  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0044  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0636515  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0036  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000227912  normal  0.244901 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0037  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000021714  normal  0.246057 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0038  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000220683  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0062  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175369  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0063  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227947  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0034  tRNA-Arg  98.36 
 
 
77 bp  113  6e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00579174  normal  0.03113 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0007  tRNA-Arg  96.72 
 
 
77 bp  105  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.454934  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0026  tRNA-Arg  96.72 
 
 
77 bp  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.338474  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0025  tRNA-Arg  96.72 
 
 
77 bp  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171373  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0011  tRNA-Arg  96.72 
 
 
77 bp  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lppt19  tRNA-Arg  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt18  tRNA-Arg  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0006  tRNA-Arg  96.72 
 
 
77 bp  105  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.574401  hitchhiker  0.000034907 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0045  tRNA-Arg  96.72 
 
 
77 bp  105  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100318  hitchhiker  0.00586866 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0040  tRNA-Arg  96.72 
 
 
77 bp  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.244587  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0010  tRNA-Arg  96.72 
 
 
77 bp  105  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.381218  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0012  tRNA-Arg  96.72 
 
 
77 bp  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0010  tRNA-Arg  96.72 
 
 
77 bp  105  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000479679 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0020  tRNA-Arg  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.845791  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0084  tRNA-Arg  96.72 
 
 
77 bp  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0061  tRNA-Arg  96.72 
 
 
77 bp  105  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.312236  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0055  tRNA-Arg  95.16 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000119585  normal  0.419154 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0056  tRNA-Arg  95.16 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000106381  normal  0.420603 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0021  tRNA-Arg  95.08 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.619754 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0029  tRNA-Arg  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0903  tRNA-Arg  90.91 
 
 
79 bp  97.6  4e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0033  tRNA-Arg  95.08 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1005  tRNA-Arg  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0024  tRNA-Arg  93.55 
 
 
77 bp  91.7  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0021  tRNA-Arg  93.55 
 
 
77 bp  91.7  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222164  normal  0.330692 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0024  tRNA-Arg  89.61 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0039  tRNA-Arg  90.41 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0291069  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0004  tRNA-Arg  89.61 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0035  tRNA-Arg  89.61 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000279493  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0036  tRNA-Arg  89.61 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000466026  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0037  tRNA-Arg  89.61 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454373  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0025  tRNA-Arg  89.61 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0048  tRNA-Arg  91.94 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0071188  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0049  tRNA-Arg  91.94 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00771179  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0007  tRNA-Arg  93.1 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.218909  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0009  tRNA-Arg  91.94 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000206186  hitchhiker  0.00000000390519 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna11  tRNA-Arg  91.94 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.163451  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0050  tRNA-Arg  91.94 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0039275  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6004  tRNA-Arg  92.98 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105111  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lppt32  tRNA-Arg  88.31 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt32  tRNA-Arg  88.31 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0020  tRNA-Arg  88.31 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000211793  normal  0.0116052 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0021  tRNA-Arg  88.31 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000000063734  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0022  tRNA-Arg  88.31 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000000656086  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0060  tRNA-Arg  92.98 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.864941  normal  0.898441 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0009  tRNA-Arg  92.98 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.702831  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0045  tRNA-Arg  88.31 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000739134 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0004  tRNA-Arg  92.86 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0201744  hitchhiker  0.000641347 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0005  tRNA-Arg  92.86 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000374311  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>