299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_R0020 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_R0020  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.845791  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0029  tRNA-Arg  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lppt19  tRNA-Arg  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt18  tRNA-Arg  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1005  tRNA-Arg  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0903  tRNA-Arg  96.1 
 
 
79 bp  129  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0045  tRNA-Arg  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000739134 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0025  tRNA-Arg  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0021  tRNA-Arg  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000000063734  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0022  tRNA-Arg  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000000656086  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0039  tRNA-Arg  95.89 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0291069  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0024  tRNA-Arg  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0035  tRNA-Arg  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000279493  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0036  tRNA-Arg  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000466026  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0037  tRNA-Arg  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454373  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0020  tRNA-Arg  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000211793  normal  0.0116052 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0064  tRNA-Arg  98.36 
 
 
77 bp  113  6e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00996897  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t083  tRNA-Arg  96.72 
 
 
77 bp  105  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t087  tRNA-Arg  96.72 
 
 
77 bp  105  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t088  tRNA-Arg  96.72 
 
 
77 bp  105  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t089  tRNA-Arg  96.72 
 
 
77 bp  105  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0050  tRNA-Arg  93.15 
 
 
77 bp  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0039275  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0048  tRNA-Arg  93.15 
 
 
77 bp  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0071188  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0004  tRNA-Arg  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0059  tRNA-Arg  96.72 
 
 
77 bp  105  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000542339  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0097  tRNA-Arg  96.72 
 
 
77 bp  105  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000131454  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0037  tRNA-Arg  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0065  tRNA-Arg  96.72 
 
 
77 bp  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00979442  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0049  tRNA-Arg  93.15 
 
 
77 bp  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00771179  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0043  tRNA-Arg  96.72 
 
 
77 bp  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000076274  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0045  tRNA-Arg  96.72 
 
 
77 bp  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000811404  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0047  tRNA-Arg  96.72 
 
 
77 bp  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000959117  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0049  tRNA-Arg  96.72 
 
 
77 bp  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000951803  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0044  tRNA-Arg  96.72 
 
 
77 bp  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000145436  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0046  tRNA-Arg  96.72 
 
 
77 bp  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000251633  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna11  tRNA-Arg  93.15 
 
 
77 bp  105  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.163451  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0048  tRNA-Arg  96.72 
 
 
77 bp  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000258429  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0050  tRNA-Arg  96.72 
 
 
77 bp  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000285185  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0042  tRNA-Arg  96.72 
 
 
77 bp  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000133594  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0044  tRNA-Arg  96.72 
 
 
77 bp  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000151065  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0046  tRNA-Arg  96.72 
 
 
77 bp  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000098167  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0048  tRNA-Arg  96.72 
 
 
77 bp  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000451917  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0023  tRNA-Arg  92.96 
 
 
77 bp  101  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00552371  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3131t  tRNA-Arg  94.03 
 
 
74 bp  101  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0022  tRNA-Arg  92.96 
 
 
77 bp  101  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00548684  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3132t  tRNA-Arg  94.03 
 
 
74 bp  101  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3133t  tRNA-Arg  94.03 
 
 
74 bp  101  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3129t  tRNA-Arg  94.03 
 
 
74 bp  101  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3134t  tRNA-Arg  94.03 
 
 
74 bp  101  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3135t  tRNA-Arg  94.03 
 
 
74 bp  101  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.669917  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0039  tRNA-Arg  92.96 
 
 
77 bp  101  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000292486  normal  0.532289 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0040  tRNA-Arg  92.96 
 
 
77 bp  101  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000315714  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0041  tRNA-Arg  92.96 
 
 
77 bp  101  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000275058  normal  0.527619 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0042  tRNA-Arg  92.96 
 
 
77 bp  101  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000264574  normal  0.527619 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0043  tRNA-Arg  92.96 
 
 
77 bp  101  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000028364  normal  0.527619 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0045  tRNA-Arg  92.96 
 
 
77 bp  101  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000301516  normal  0.527619 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0049  tRNA-Arg  96.55 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000321594  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0039  tRNA-Arg  96.55 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0446173  hitchhiker  0.00751458 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0034  tRNA-Arg  96.55 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0228337  hitchhiker  0.00733773 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0036  tRNA-Arg  96.55 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.042903  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0035  tRNA-Arg  96.55 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.042903  hitchhiker  0.00756104 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0037  tRNA-Arg  96.55 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0424751  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0113  tRNA-Arg  96.55 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.196307  hitchhiker  0.0000602904 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0115  tRNA-Arg  96.55 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.125071  hitchhiker  0.0000608145 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna111  tRNA-Arg  92.86 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00293303  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0050  tRNA-Arg  92.31 
 
 
78 bp  99.6  9e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna112  tRNA-Arg  92.86 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00685075  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0108  tRNA-Arg  96.55 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000608145 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0107  tRNA-Arg  96.55 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000608145 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0109  tRNA-Arg  96.55 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00006448 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0114  tRNA-Arg  96.55 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.195511  hitchhiker  0.0000613432 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna110  tRNA-Arg  92.86 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00293303  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna108  tRNA-Arg  92.86 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000789461  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna109  tRNA-Arg  92.86 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000319749  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna114  tRNA-Arg  92.86 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0142172  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna113  tRNA-Arg  92.86 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00652394  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0043  tRNA-Arg  96.55 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0814997  hitchhiker  0.00811057 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0110  tRNA-Arg  96.55 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.607577  hitchhiker  0.0000634029 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0112  tRNA-Arg  96.55 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456139  hitchhiker  0.0000639392 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0050  tRNA-Arg  92.31 
 
 
78 bp  99.6  9e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.557723  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0050  tRNA-Arg  96.55 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000319175  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0051  tRNA-Arg  96.55 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000808669  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0053  tRNA-Arg  96.55 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000298412  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0052  tRNA-Arg  96.55 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000305181  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0055  tRNA-Arg  96.55 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000268811  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna106  tRNA-Arg  92.86 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000169695  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0056  tRNA-Arg  96.55 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000025331  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0040  tRNA-Arg  96.55 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0409626  hitchhiker  0.00769115 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0042  tRNA-Arg  96.55 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.046483  hitchhiker  0.00783232 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0041  tRNA-Arg  96.55 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0453151  hitchhiker  0.00788518 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0079  tRNA-Arg  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000061602  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0080  tRNA-Arg  91.78 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000233743  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0077  tRNA-Arg  91.78 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000716248  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03502  tRNA-Arg  96.49 
 
 
74 bp  97.6  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03503  tRNA-Arg  96.49 
 
 
74 bp  97.6  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0083  tRNA-Arg  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000215013  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0106  tRNA-Arg  95.08 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000188181  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0082  tRNA-Arg  91.78 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000302683  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0108  tRNA-Arg  95.08 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000272922  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0107  tRNA-Arg  95.08 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000203726  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>