299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_R0042 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_t083  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t087  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t089  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0043  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000076274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0045  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000811404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0047  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000959117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0049  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000951803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0044  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000145436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0046  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000251633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0048  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000258429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0050  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000285185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0042  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000133594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0044  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000151065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0046  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000098167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0048  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000451917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0037  tRNA-Arg  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0424751  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0041  tRNA-Arg  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0453151  hitchhiker  0.00788518 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0104  tRNA-Arg  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000547181  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0109  tRNA-Arg  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00006448 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0119  tRNA-Arg  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000131096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0112  tRNA-Arg  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456139  hitchhiker  0.0000639392 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0106  tRNA-Arg  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000188181  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0118  tRNA-Arg  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000119067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0117  tRNA-Arg  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000112266  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t085  tRNA-Arg  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t088  tRNA-Arg  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0113  tRNA-Arg  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000084866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0115  tRNA-Arg  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000013002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0107  tRNA-Arg  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000608145 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0043  tRNA-Arg  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0814997  hitchhiker  0.00811057 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0108  tRNA-Arg  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000272922  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0110  tRNA-Arg  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000105777  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0116  tRNA-Arg  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000102508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0107  tRNA-Arg  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000203726  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0109  tRNA-Arg  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000932697  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0053  tRNA-Arg  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000298412  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0056  tRNA-Arg  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000025331  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0095  tRNA-Arg  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000145401  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0093  tRNA-Arg  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000449843  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0095  tRNA-Arg  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000787124  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0098  tRNA-Arg  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000015782  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0099  tRNA-Arg  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165314  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0100  tRNA-Arg  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000127337  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0101  tRNA-Arg  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000012367  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0039  tRNA-Arg  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0446173  hitchhiker  0.00751458 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0091  tRNA-Arg  98.7 
 
 		 77 bp  145  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00116714  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t021  tRNA-Arg  98.68 
 
 		 77 bp  143  7e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000593467  hitchhiker  0.0000000311481 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t019  tRNA-Arg  98.68 
 
 		 77 bp  143  7e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000120774  hitchhiker  0.0000000298076 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t022  tRNA-Arg  98.68 
 
 		 77 bp  143  7e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000204678  hitchhiker  0.0000000336806 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t023  tRNA-Arg  98.68 
 
 		 77 bp  143  7e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000185233  hitchhiker  0.0000000311481 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t024  tRNA-Arg  98.68 
 
 		 77 bp  143  7e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000647415  hitchhiker  0.000000189876 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t026  tRNA-Arg  98.68 
 
 		 77 bp  143  7e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000584816  hitchhiker  0.00000103487 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0038  tRNA-Arg  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000238811  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0039  tRNA-Arg  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000255751  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0041  tRNA-Arg  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000126984  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0065  tRNA-Arg  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00979442  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0046  tRNA-Arg  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.345279  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0047  tRNA-Arg  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.349818  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0049  tRNA-Arg  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.871156  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0097  tRNA-Arg  97.4 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000131454  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t086  tRNA-Arg  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0094  tRNA-Arg  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000391203  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0064  tRNA-Arg  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00996897  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0044  tRNA-Arg  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000826054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0046  tRNA-Arg  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000243564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0045  tRNA-Arg  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000233183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0047  tRNA-Arg  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000279999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0059  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000542339  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0043  tRNA-Arg  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000142097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0045  tRNA-Arg  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000160555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0092  tRNA-Arg  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00111673  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0089  tRNA-Arg  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00125706  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0039  tRNA-Arg  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000292486  normal  0.532289 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0040  tRNA-Arg  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000315714  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0041  tRNA-Arg  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000275058  normal  0.527619 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0042  tRNA-Arg  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000264574  normal  0.527619 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0043  tRNA-Arg  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000028364  normal  0.527619 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0045  tRNA-Arg  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000301516  normal  0.527619 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0027  tRNA-Arg  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000312011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0028  tRNA-Arg  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000292353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0029  tRNA-Arg  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000030616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0030  tRNA-Arg  94.81 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000300498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0042  tRNA-Arg  95.83 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.046483  hitchhiker  0.00783232 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0034  tRNA-Arg  95.83 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0228337  hitchhiker  0.00733773 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0108  tRNA-Arg  95.83 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000608145 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0110  tRNA-Arg  95.83 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.607577  hitchhiker  0.0000634029 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0049  tRNA-Arg  95.83 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000321594  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0050  tRNA-Arg  95.83 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000319175  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0113  tRNA-Arg  95.83 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.196307  hitchhiker  0.0000602904 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0051  tRNA-Arg  95.83 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000808669  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0052  tRNA-Arg  95.83 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000305181  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0114  tRNA-Arg  95.83 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.195511  hitchhiker  0.0000613432 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0115  tRNA-Arg  95.83 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.125071  hitchhiker  0.0000608145 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0055  tRNA-Arg  95.83 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000268811  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0040  tRNA-Arg  95.83 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0409626  hitchhiker  0.00769115 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0036  tRNA-Arg  95.83 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.042903  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0035  tRNA-Arg  95.83 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.042903  hitchhiker  0.00756104 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1046  tRNA-Arg  94.67 
 
 		 77 bp  117  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.65202  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0022  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  117  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00548684  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0023  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  117  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00552371  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>