299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_R0039 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_R0039  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0291069  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt19  tRNA-Arg  98.63 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt18  tRNA-Arg  98.63 
 
 		 77 bp  137  4e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0020  tRNA-Arg  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.845791  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0029  tRNA-Arg  94.52 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1005  tRNA-Arg  93.15 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0903  tRNA-Arg  93.15 
 
 		 79 bp  105  1e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0025  tRNA-Arg  93.15 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0024  tRNA-Arg  93.15 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0003  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000378947  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0048  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0071188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0050  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0039275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0045  tRNA-Arg  91.78 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000739134 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0049  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00771179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna11  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.163451  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t083  tRNA-Arg  91.55 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t087  tRNA-Arg  91.55 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t088  tRNA-Arg  91.55 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t089  tRNA-Arg  91.55 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0097  tRNA-Arg  91.55 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000131454  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0064  tRNA-Arg  91.55 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00996897  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0065  tRNA-Arg  91.55 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00979442  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0043  tRNA-Arg  91.55 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000076274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0045  tRNA-Arg  91.55 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000811404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0047  tRNA-Arg  91.55 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000959117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0049  tRNA-Arg  91.55 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000951803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0044  tRNA-Arg  91.55 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000145436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0046  tRNA-Arg  91.55 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000251633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0048  tRNA-Arg  91.55 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000258429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0050  tRNA-Arg  91.55 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000285185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0042  tRNA-Arg  91.55 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000133594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0044  tRNA-Arg  91.55 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000151065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0046  tRNA-Arg  91.55 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000098167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0048  tRNA-Arg  91.55 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000451917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0004  tRNA-Arg  90.41 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0035  tRNA-Arg  90.41 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000279493  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0036  tRNA-Arg  90.41 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000466026  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0037  tRNA-Arg  90.41 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454373  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0037  tRNA-Arg  90.41 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0059  tRNA-Arg  93.44 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000542339  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0020  tRNA-Arg  90.41 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000211793  normal  0.0116052 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna10  tRNA-Arg  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.107608  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0021  tRNA-Arg  90.41 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000000063734  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0022  tRNA-Arg  90.41 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000000656086  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0006  tRNA-Arg  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0051  tRNA-Arg  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.524822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3133t  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3135t  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.669917  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3134t  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3132t  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3129t  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3131t  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0099  tRNA-Arg  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165314  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0100  tRNA-Arg  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000127337  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t024  tRNA-Arg  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000647415  hitchhiker  0.000000189876 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0106  tRNA-Arg  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000188181  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0107  tRNA-Arg  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000608145 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0091  tRNA-Arg  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00116714  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0094  tRNA-Arg  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000391203  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0107  tRNA-Arg  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000203726  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t021  tRNA-Arg  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000593467  hitchhiker  0.0000000311481 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t085  tRNA-Arg  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t086  tRNA-Arg  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0116  tRNA-Arg  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000102508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0095  tRNA-Arg  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000145401  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0109  tRNA-Arg  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000932697  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0108  tRNA-Arg  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000272922  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0041  tRNA-Arg  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0453151  hitchhiker  0.00788518 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t019  tRNA-Arg  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000120774  hitchhiker  0.0000000298076 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0043  tRNA-Arg  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0814997  hitchhiker  0.00811057 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0089  tRNA-Arg  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00125706  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0093  tRNA-Arg  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000449843  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0095  tRNA-Arg  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000787124  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0109  tRNA-Arg  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00006448 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0098  tRNA-Arg  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000015782  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t026  tRNA-Arg  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000584816  hitchhiker  0.00000103487 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0056  tRNA-Arg  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000025331  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0113  tRNA-Arg  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000084866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0101  tRNA-Arg  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000012367  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0110  tRNA-Arg  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000105777  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0037  tRNA-Arg  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0424751  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0044  tRNA-Arg  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000826054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0046  tRNA-Arg  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000243564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0092  tRNA-Arg  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00111673  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0045  tRNA-Arg  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000233183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0047  tRNA-Arg  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000279999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0117  tRNA-Arg  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000112266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t023  tRNA-Arg  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000185233  hitchhiker  0.0000000311481 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t022  tRNA-Arg  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000204678  hitchhiker  0.0000000336806 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0053  tRNA-Arg  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000298412  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0039  tRNA-Arg  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0446173  hitchhiker  0.00751458 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0115  tRNA-Arg  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000013002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0118  tRNA-Arg  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000119067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0119  tRNA-Arg  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000131096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0112  tRNA-Arg  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456139  hitchhiker  0.0000639392 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0104  tRNA-Arg  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000547181  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0043  tRNA-Arg  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000142097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0045  tRNA-Arg  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000160555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0049  tRNA-Arg  93.1 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000321594  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0115  tRNA-Arg  93.1 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.125071  hitchhiker  0.0000608145 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>