17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_R0010 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_R0010  tRNA-Trp  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.474301 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0052  tRNA-Trp  94.44 
 
 		 74 bp  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0183126  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Trp-1  tRNA-Trp  92.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0043  tRNA-Trp  90.91 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0043  tRNA-Trp  90.91 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0044  tRNA-Trp  90.57 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0083  tRNA-Trp  90.57 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.687227  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0029  tRNA-Trp  90.57 
 
 		 71 bp  65.9  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0034  tRNA-Trp  88.46 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000403563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0016  tRNA-Trp  88.46 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000948806  normal  0.0320908 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0083  tRNA-Trp  94.29 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000716294  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0047  tRNA-Trp  94.29 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0096  tRNA-Trp  94.29 
 
 		 71 bp  54  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000269126  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0108  tRNA-Trp  94.29 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.323261  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1828  tRNA-Trp  88 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.143602  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0109  tRNA-Trp  91.43 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00430979  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0067  tRNA-Trp  89.47 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000198819  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>