45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_R0108 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_R0047  tRNA-Trp  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0108  tRNA-Trp  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.323261  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0096  tRNA-Trp  100 
 
 		 71 bp  141  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000269126  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0109  tRNA-Trp  98.59 
 
 		 71 bp  133  6e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00430979  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0083  tRNA-Trp  97.3 
 
 		 74 bp  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000716294  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5680  tRNA-Trp  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00328754  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0534  tRNA-Trp  95.95 
 
 		 76 bp  123  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.2225799999999998e-31 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4768  tRNA-Trp  95.95 
 
 		 76 bp  123  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000283777  hitchhiker  8.87707e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5715  tRNA-Trp  95.95 
 
 		 76 bp  123  6e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00259208  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0609  tRNA-Trp  95.95 
 
 		 76 bp  123  6e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893119  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Trp-1  tRNA-Trp  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000185575  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Trp-2  tRNA-Trp  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000188649  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Trp-2  tRNA-Trp  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00498789  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Trp-2  tRNA-Trp  95.95 
 
 		 77 bp  123  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0228922  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Trp-2  tRNA-Trp  95.77 
 
 		 71 bp  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000102119  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5703  tRNA-Trp  95.77 
 
 		 71 bp  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00201632  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0794  tRNA-Trp  95.77 
 
 		 76 bp  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.48355e-33 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Trp-1  tRNA-Trp  95.77 
 
 		 74 bp  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0685849  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4562  tRNA-Trp  95.77 
 
 		 76 bp  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000250709  normal  0.083174 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5741  tRNA-Trp  95.77 
 
 		 76 bp  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000134738  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0869  tRNA-Trp  95.77 
 
 		 76 bp  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000683434  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Trp-1  tRNA-Trp  95.77 
 
 		 74 bp  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000236479  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Trp-1  tRNA-Trp  95.77 
 
 		 74 bp  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.247353  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0087  tRNA-Trp  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00552735  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0113  tRNA-Trp  94.37 
 
 		 71 bp  109  9.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00198047  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0043  tRNA-Trp  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0043  tRNA-Trp  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Trp-1  tRNA-Trp  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Trp-2  tRNA-Trp  92.42 
 
 		 71 bp  91.7  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Trp-1  tRNA-Trp  92.42 
 
 		 71 bp  91.7  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.901968  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0091  tRNA-Trp  90.91 
 
 		 71 bp  83.8  0.000000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2566  tRNA-Trp  87.88 
 
 		 71 bp  67.9  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0052  tRNA-Trp  87.88 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0183126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0067  tRNA-Trp  96.97 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000198819  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0010  tRNA-Trp  94.29 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.474301 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0054  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0057  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00401705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2130  tRNA-Trp  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0028  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.467787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2420  tRNA-Trp  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0060  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0005  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0047  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000613865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0006  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0014  tRNA-Trp  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00024389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>