More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_R0010 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_R0010  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0001  tRNA-Phe  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.154454 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0046  tRNA-Phe  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS02241  tRNA-Phe  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000057797  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0062  tRNA-Phe  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0070  tRNA-Phe  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00525701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0060  tRNA-Phe  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102319 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Phe-2  tRNA-Phe  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.137166  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0006  tRNA-Phe  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0354  tRNA-Phe  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.570155  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0053  tRNA-Phe  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000574289  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0021  tRNA-Phe  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.824976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0058  tRNA-Phe  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0136  tRNA-Phe  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.740325  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0037  tRNA-Phe  95.59 
 
 		 73 bp  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2797  tRNA-Phe  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2283  tRNA-Phe  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00760405  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0159  tRNA-Phe  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.369913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0169  tRNA-Phe  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.601595  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2361  tRNA-Phe  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.979776  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0002  tRNA-Phe  93.24 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0044  tRNA-Phe  93.15 
 
 		 76 bp  105  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000279545  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0999  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.347989  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1129  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt29  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt29  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0011  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443176  normal  0.507141 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0055  tRNA-Phe  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598604 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0028  tRNA-Phe  92.96 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.748301  normal  0.0311431 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0076  tRNA-Phe  91.89 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148621  hitchhiker  0.00000000192681 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5887  tRNA-Phe  91.89 
 
 		 78 bp  99.6  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0039  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.744114  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60610  tRNA-Phe  92.65 
 
 		 73 bp  95.6  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.820326  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0041  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000184643  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0003  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0040  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000293761  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0015  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.312952  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0075  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.106452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0018  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0049  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.000790035  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0075  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283393  normal  0.209265 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0075  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154844  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68030  tRNA-Phe  92.65 
 
 		 73 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0351538  hitchhiker  0.008643 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0072  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0389238  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0056  tRNA-Phe  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.744402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60620  tRNA-Phe  92.65 
 
 		 73 bp  95.6  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.787941  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0005  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0046  tRNA-Phe  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00122164  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0005  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0029  tRNA-Phe  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000341854  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0043  tRNA-Phe  93.55 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.57647 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0264  tRNA-Phe  94.83 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00100178  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0082  tRNA-Phe  97.96 
 
 		 73 bp  89.7  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0006  tRNA-Phe  92.19 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0241224  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0055  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.108709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0016  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000022275  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0059  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.383057  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0053  tRNA-Phe  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.744233  normal  0.828825 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0008  tRNA-Phe  97.87 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0066  tRNA-Phe  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0398911  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t03  tRNA-Phe  100 
 
 		 73 bp  85.7  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.485115  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna30  tRNA-Phe  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.319262  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0065  tRNA-Phe  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.132855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0005  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.497838 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0029  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4594  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0004  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0037  tRNA-Phe  97.87 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.394393 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0442  tRNA-Phe  93.1 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0002  tRNA-Phe  89.19 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.113905  normal  0.0311274 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2270  tRNA-Phe  93.1 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.105735  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0145  tRNA-Phe  89.19 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0001  tRNA-Phe  93.1 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0729187  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Phe-1  tRNA-Phe  93.1 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.837843  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0014  tRNA-Phe  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.58788  hitchhiker  0.00239858 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0063  tRNA-Phe  89.19 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2143  tRNA-Phe  93.1 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0080  tRNA-Phe  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000484766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1357  tRNA-Phe  93.1 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.503492  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0059  tRNA-Phe  89.19 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.119328  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0289  tRNA-Phe  93.1 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1750  tRNA-Phe  93.1 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0006  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0001  tRNA-Phe  91.8 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0473028  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0067  tRNA-Phe  91.8 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000184949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0032  tRNA-Phe  89.04 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62211  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0034  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000955426  normal  0.448764 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0113  tRNA-Phe  100 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0052  tRNA-Phe  92.98 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000909923  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0044  tRNA-Phe  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0044  tRNA-Phe  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0066  tRNA-Phe  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0346272  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0005  tRNA-Phe  97.73 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0044  tRNA-Phe  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16456  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0046  tRNA-Phe  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0069  tRNA-Phe  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0178252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0063  tRNA-Phe  88.89 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0007  tRNA-Phe  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0572306 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0054  tRNA-Phe  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.297231 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>