26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_R0029 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_R0029  tRNA-Trp  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.263446 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna152  tRNA-Trp  93.88 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.696171  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna037  tRNA-Trp  93.88 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2454  tRNA-Trp  93.88 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00245  tRNA-Trp  93.48 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1114t  tRNA-Trp  93.48 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.143178  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3214t  tRNA-Trp  93.48 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3141t  tRNA-Trp  93.48 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.57879  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01015  tRNA-Trp  93.48 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1323  tRNA-Trp  85.71 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000340383  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0016  tRNA-Trp  94.74 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000083767  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0397  tRNA-Trp  86.67 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000104707  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1463  tRNA-Trp  88 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000838857  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1670  tRNA-Trp  88 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00343188  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1720  tRNA-Trp  88 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000880409  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0442  tRNA-Trp  88 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00029121  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Trp-1  tRNA-Trp  88 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.208589  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4779  tRNA-Trp  84.42 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.159164  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1116  tRNA-Trp  84.42 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.493252  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0160  tRNA-Trp  84.42 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00344423  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0161  tRNA-Trp  84.42 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0037274  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0004  tRNA-Trp  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000305052  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0055  tRNA-Arg  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0773774  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0003  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0003  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000538631 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0005  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000152331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>