33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0397 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0397  tRNA-Trp  100 
 
 		 78 bp  155  2e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000104707  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0063  tRNA-Trp  87.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t08  tRNA-Trp  89.8 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00447017  unclonable  0.000000239322 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0007  tRNA-Trp  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000241707  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0083  tRNA-Trp  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0000000761194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0020  tRNA-Trp  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00786701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0017  tRNA-Trp  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225393  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R86  tRNA-Trp  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000013875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA66  tRNA-Trp  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000000464617  normal  0.636582 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t08  tRNA-Trp  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.220633  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Trp-1  tRNA-Trp  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0487653  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0029  tRNA-Trp  86.67 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.263446 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0013  tRNA-Trp  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0042  tRNA-Trp  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0008  tRNA-Trp  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000769382 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0019  tRNA-Trp  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0117064  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0013  tRNA-Trp  85.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00030816  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0026  tRNA-Trp  84.06 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0026  tRNA-Trp  84.06 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.200362  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Trp-1  tRNA-Trp  83.56 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000619868  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0027  tRNA-Trp  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0066  tRNA-Trp  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0052  tRNA-Trp  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0064  tRNA-Trp  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000899944 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09690  tRNA-Trp  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000497928  hitchhiker  0.00000737021 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0055  tRNA-Trp  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00911957  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0044  tRNA-Trp  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00376159  normal  0.558412 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0011  tRNA-Trp  96.43 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.053927 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0033  tRNA-Trp  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.0000000398886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0019  tRNA-Trp  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0292581 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1323  tRNA-Trp  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000340383  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0044  tRNA-Trp  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.910228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0024  tRNA-Trp  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>