271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_R0026 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_R0026  tRNA-Trp  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0026  tRNA-Trp  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.200362  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0019  tRNA-Trp  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0292581 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0024  tRNA-Trp  98.68 
 
 
76 bp  143  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0064  tRNA-Trp  93.51 
 
 
77 bp  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000899944 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0027  tRNA-Trp  93.51 
 
 
77 bp  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0320  tRNA-Trp  92.11 
 
 
78 bp  103  6e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000012562  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0041  tRNA-Trp  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000135677  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0009  tRNA-Trp  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000520424  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0034  tRNA-Trp  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0532216  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0047  tRNA-Trp  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.512574  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0018  tRNA-Trp  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.341765  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1869  tRNA-Trp  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00000841204  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0015  tRNA-Trp  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00419833  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0024  tRNA-Trp  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.648617  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0055  tRNA-Trp  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00911957  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09690  tRNA-Trp  92.21 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000497928  hitchhiker  0.00000737021 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0014  tRNA-Trp  92.21 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.336426  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0063  tRNA-Trp  93.15 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0011  tRNA-Trp  92.21 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0044  tRNA-Trp  92.21 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00376159  normal  0.558412 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Trp-1  tRNA-Trp  91.67 
 
 
76 bp  95.6  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.149464  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0823  tRNA-Trp  90.79 
 
 
78 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0144883  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0013  tRNA-Trp  91.55 
 
 
76 bp  93.7  5e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00030816  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna7  tRNA-Trp  90.54 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.387032  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0018  tRNA-Trp  90.54 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000348317  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0044  tRNA-Trp  90.91 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.910228  normal 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Trp-1  tRNA-Trp  90.91 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0487653  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0017  tRNA-Trp  90.91 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  9.66883e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0008  tRNA-Trp  90.91 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000769382 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08690  tRNA-Trp  90.41 
 
 
73 bp  89.7  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000355239  hitchhiker  0.00161168 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0011  tRNA-Trp  90.91 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.053927 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0052  tRNA-Trp  91.78 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60050  tRNA-Trp  90.41 
 
 
73 bp  89.7  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0021  tRNA-Trp  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000328782  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt07  tRNA-Trp  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt07  tRNA-Trp  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0312  tRNA-Trp  90.28 
 
 
78 bp  87.7  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.21039  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0036  tRNA-Trp  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000784105  unclonable  0.0000000173687 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0007  tRNA-Trp  90.28 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00017287  hitchhiker  0.00000137659 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0026  tRNA-Trp  96.08 
 
 
73 bp  85.7  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.920402  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t11  tRNA-Trp  96.08 
 
 
73 bp  85.7  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000011334  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0018  tRNA-Trp  96.08 
 
 
73 bp  85.7  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000669798  decreased coverage  0.0000968931 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0017  tRNA-Trp  96.08 
 
 
73 bp  85.7  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000751689  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0006  tRNA-Trp  96.08 
 
 
76 bp  85.7  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0868408  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0053  tRNA-Trp  96.08 
 
 
73 bp  85.7  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000643655  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0013  tRNA-Trp  96.08 
 
 
76 bp  85.7  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000203485  hitchhiker  0.00313302 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0051  tRNA-Trp  96 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00000000551326  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0051  tRNA-Trp  96 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128882  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0019  tRNA-Trp  89.61 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0117064  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0007  tRNA-Trp  88.89 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000241707  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0017  tRNA-Trp  88.16 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000589441  hitchhiker  0.00131035 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0040  tRNA-Trp  92.86 
 
 
73 bp  79.8  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0487601  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0066  tRNA-Trp  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154633  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1323  tRNA-Trp  88.89 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000340383  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0021  tRNA-Trp  91.53 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000394935  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08670  tRNA-Trp  87.84 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000627266  hitchhiker  0.0000000142101 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0016  tRNA-Trp  91.23 
 
 
78 bp  73.8  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.825811  normal  0.984478 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0013  tRNA-Trp  89.04 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0017  tRNA-Trp  91.23 
 
 
78 bp  73.8  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119473 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0042  tRNA-Trp  89.04 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0021  tRNA-Trp  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0007  tRNA-Trp  91.07 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000145435  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0011  tRNA-Trp  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000961162  hitchhiker  0.00000879757 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0013  tRNA-Trp  91.07 
 
 
73 bp  71.9  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.799114  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21050  tRNA-Trp  93.75 
 
 
73 bp  71.9  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.461019  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0038  tRNA-Trp  93.62 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.23193 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0048  tRNA-Trp  89.83 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235663  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0003  tRNA-Trp  89.83 
 
 
76 bp  69.9  0.00000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.629076  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Trp-1  tRNA-Trp  93.48 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000845148  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1220  tRNA-Trp  93.48 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.28673  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0018  tRNA-Trp  93.48 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0871425  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0050  tRNA-Trp  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391043  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0069  tRNA-Trp  93.48 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0068  tRNA-Trp  93.48 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.865421  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0039  tRNA-Trp  93.48 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.319425  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0065  tRNA-Trp  93.48 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0927155  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0003  tRNA-Trp  93.48 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.7715 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Trp-1  tRNA-Trp  86.96 
 
 
73 bp  65.9  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000619868  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0013  tRNA-Trp  91.84 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000123102  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1463  tRNA-Trp  86.96 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000838857  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Trp-1  tRNA-Trp  86.96 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.208589  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t08  tRNA-Trp  91.84 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.220633  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA66  tRNA-Trp  91.84 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000000464617  normal  0.636582 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0061  tRNA-Arg  91.84 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000000631723  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R86  tRNA-Trp  91.84 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000013875  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_R0068  tRNA-Trp  90.57 
 
 
73 bp  65.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.423507  normal  0.417359 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0083  tRNA-Trp  91.84 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0000000761194  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0017  tRNA-Trp  91.84 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225393  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0013  tRNA-Trp  91.84 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00144283  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0029  tRNA-Trp  91.84 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0036  tRNA-Trp  95.12 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0303875  normal  0.494779 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0035  tRNA-Trp  91.84 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.349144  normal  0.230187 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1670  tRNA-Trp  86.96 
 
 
78 bp  65.9  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00343188  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0020  tRNA-Trp  91.84 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00786701  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1720  tRNA-Trp  86.96 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000880409  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0046  tRNA-Trp  91.84 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0008  tRNA-Trp  85.53 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00647008 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0008  tRNA-Trp  91.67 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0032  tRNA-Trp  91.67 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>