49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_R0061 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_R0061  tRNA-Lys  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0017  tRNA-Lys  90.77 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.303738  normal  0.0470778 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0084  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0040  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0039  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.767865  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0033  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0040  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.565678  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0058  tRNA-Lys  95.35 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0010  tRNA-Lys  97.37 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0550905 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06840  tRNA-Lys  93.48 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37540  tRNA-Lys  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0863573  normal  0.917187 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0016  tRNA-Lys  92.31 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0018  tRNA-Lys  90.38 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.780391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0052  tRNA-Lys  92.31 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00451964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0021  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0005  tRNA-Lys  88.14 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0050  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0046  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0640461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0004  tRNA-Lys  88.14 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0763324 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0020  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.405575 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0011  tRNA-Lys  91.3 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0056  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4589  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0062  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0026  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.21552  normal  0.0153028 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0824  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0733527  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0029  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.781659  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt04  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301471  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0059  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0023  tRNA-Lys  86.44 
 
 		 72 bp  54  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.35633 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0061  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0036  tRNA-Lys  85.07 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0017  tRNA-Asn  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0031  tRNA-Asn  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0078  tRNA-Lys  85.51 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.561657  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0035  tRNA-Lys  91.89 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.073157  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0047  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.500835  normal  0.0267795 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0552  tRNA-Lys  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146239  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0054  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0055  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0031  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.303398  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0003  tRNA-Asn  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0045  tRNA-Met  87.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0035  tRNA-Lys  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198298 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0061  tRNA-Lys  85.45 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0165866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLys03  tRNA-Lys  88.1 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00045675  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLys02  tRNA-Lys  88.1 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000433132  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLys01  tRNA-Lys  88.1 
 
 		 79 bp  44.1  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000157886  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0021  tRNA-Lys  85.19 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>