97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_37540 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_37540  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0863573  normal  0.917187 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0017  tRNA-Lys  94.74 
 
 		 75 bp  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.303738  normal  0.0470778 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06840  tRNA-Lys  92.65 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0011  tRNA-Lys  91.3 
 
 		 76 bp  89.7  9e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0084  tRNA-Lys  92.19 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0010  tRNA-Lys  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0550905 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0048  tRNA-Lys  93.1 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0046  tRNA-Lys  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0027  tRNA-Lys  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0211133  hitchhiker  0.000000873105 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0029  tRNA-Lys  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000384489  normal  0.924155 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0021  tRNA-Lys  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.682911  normal  0.0277835 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0020  tRNA-Lys  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.454268  normal  0.255497 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0009  tRNA-Lys  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.66226  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0059  tRNA-Lys  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0061  tRNA-Lys  86.3 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0018  tRNA-Lys  86.84 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.780391  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0061  tRNA-Lys  89.29 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0056  tRNA-Lys  85.33 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0021  tRNA-Lys  85.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0022  tRNA-Lys  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0020  tRNA-Lys  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.405575 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0037  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00809358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0078  tRNA-Lys  85.51 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.561657  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0043  tRNA-Lys  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0814782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0039  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0153762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0038  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0168892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0036  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0360191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0035  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0379309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0020  tRNA-Lys  84.93 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.349925 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0050  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0058  tRNA-Lys  91.11 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0021  tRNA-Lys  86.89 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0056  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0012  tRNA-Lys  85.29 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0025  tRNA-Lys  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000416946  unclonable  9.48259e-19 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0046  tRNA-Lys  85.29 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0640461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0050  tRNA-Lys  84 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0044  tRNA-Lys  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0696319 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0054  tRNA-Lys  85.07 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0056  tRNA-Lys  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0060  tRNA-Lys  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.268431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0058  tRNA-Lys  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.314069  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0052  tRNA-Lys  84.85 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00451964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0048  tRNA-Lys  83.78 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.514987  normal  0.0153683 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0030  tRNA-Lys  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0060  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.260186  normal  0.112071 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26570  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000438766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0047  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0052  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0125474  normal  0.521924 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0061  tRNA-Ser  91.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.117486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0055  tRNA-Lys  84.06 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0047  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0069  tRNA-Lys  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.989789  normal  0.0574116 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0045  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.499145 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0045  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0064  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0065  tRNA-Lys  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.522927  normal  0.38542 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0020  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.768536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6718  integrase family protein  100 
 
 		 1971 bp  50.1  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0024  tRNA-Lys  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0016  tRNA-Lys  83.82 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0043  tRNA-Lys  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000129549  unclonable  0.000000000302545 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0060  tRNA-Lys  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.845098  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0050  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.016026  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0030  tRNA-Lys  83.33 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.186528  normal  0.069463 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0025  tRNA-Lys  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0042  tRNA-Lys  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000326877  unclonable  0.000000000331306 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0047  tRNA-Lys  83.82 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.500835  normal  0.0267795 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0024  tRNA-Lys  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0023  tRNA-Lys  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0021  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0051  tRNA-Lys  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000619589  hitchhiker  0.0000190999 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0052  tRNA-Lys  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000683016  hitchhiker  0.000091513 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0053  tRNA-Lys  90 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000619589  hitchhiker  0.0000900565 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna43  tRNA-Lys  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0022  tRNA-Lys  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0195324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0060  tRNA-Lys  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0048  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000334788 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0078  tRNA-Lys  82.89 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0983786 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0033  tRNA-Lys  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0020  tRNA-Lys  84.75 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.789057  hitchhiker  0.000213663 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0021  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0223397 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0015  tRNA-Lys  91.43 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0053  tRNA-Lys  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0023  tRNA-Lys  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0012  tRNA-Lys  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000017213  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  83.87 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.489322  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_722  tRNA-Lys  83.87 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0030  tRNA-Lys  82.86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1355  tRNA-Lys  84.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0077651 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0058  tRNA-Lys  83.87 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0060  tRNA-Lys  82.86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00479449  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0026  tRNA-Lys  82.86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0061  tRNA-Lys  82.86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00229063  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0023  tRNA-Lys  83.87 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.299591  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0035  tRNA-Lys  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198298 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0025  tRNA-Lys  82.86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.949692  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>