79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_R0040 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011145  AnaeK_R0040  tRNA-Lys  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.565678  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0039  tRNA-Lys  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.767865  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0040  tRNA-Lys  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0061  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0023  tRNA-Lys  89.83 
 
 		 72 bp  69.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.35633 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0017  tRNA-Lys  87.69 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.303738  normal  0.0470778 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0033  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.773389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0084  tRNA-Lys  87.32 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0061  tRNA-Lys  89.09 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0165866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0021  tRNA-Lys  88.33 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.682911  normal  0.0277835 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0051  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.106867  normal  0.0466921 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0001  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0487853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0084  tRNA-Lys  100 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0020  tRNA-Lys  85.94 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.405575 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0021  tRNA-Lys  85.94 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0018  tRNA-Lys  83.82 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.780391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0046  tRNA-Lys  85.94 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0640461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0052  tRNA-Lys  86.67 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00451964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0050  tRNA-Lys  85.94 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0056  tRNA-Lys  86.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0005  tRNA-Lys  84.75 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0060  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.260186  normal  0.112071 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0014  tRNA-Gly  85.45 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000156388  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0004  tRNA-Lys  84.75 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0763324 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0069  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.024134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0064  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0006  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.736835  normal  0.711036 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0007  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0022  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.600355 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0038  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0062  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0018  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.395535  normal  0.2939 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0008  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.054171  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0021  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.292095 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0009  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0078  tRNA-Lys  86.21 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0983786 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0030  tRNA-Lys  86.21 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4566  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.778703  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0036  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0028  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.196186  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0017  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.292285 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0078  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.561657  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0006  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0021  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.13563  hitchhiker  0.00625278 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0023  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0320395 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0043  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.465009  normal  0.488782 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0061  tRNA-Lys  86.21 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00229063  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0060  tRNA-Lys  86.21 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00479449  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0012  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0041  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0055  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.3002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0031  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0561  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000476059  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0052  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0161202 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0028  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.721667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1370  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.598749  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0026  tRNA-Lys  86.21 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0025  tRNA-Lys  86.21 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.949692  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3259  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0040    96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569019  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0017  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00877648 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0041  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.226766  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0007  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0521  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t22  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.656712  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0056  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1660  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0037  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0035  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0064  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1214  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA37  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0779293 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1952  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3244  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.489776  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3206  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2658  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0806589  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0010  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0824  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>