201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_R0061 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_R0061  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0059  tRNA-Lys  94.52 
 
 		 76 bp  113  6e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0047  tRNA-Lys  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.500835  normal  0.0267795 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0055  tRNA-Lys  96.43 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0016  tRNA-Lys  92.42 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0020  tRNA-Lys  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.405575 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0012  tRNA-Lys  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0046  tRNA-Lys  94.64 
 
 		 73 bp  87.7  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0640461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0021  tRNA-Lys  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0021  tRNA-Lys  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0054  tRNA-Lys  96.08 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0052  tRNA-Lys  90.91 
 
 		 73 bp  83.8  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00451964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0010  tRNA-Lys  89.04 
 
 		 73 bp  81.8  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0550905 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01680  tRNA-Lys  90.62 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0020  tRNA-Lys  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.349925 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0043  tRNA-Lys  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0814782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0022  tRNA-Lys  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0030  tRNA-Lys  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.186528  normal  0.069463 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0056  tRNA-Lys  87.67 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0039  tRNA-Lys  92.31 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0040  tRNA-Lys  92.31 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0031  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.303398  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0056  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.240873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28780  tRNA-Lys  92.31 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.140061 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0048  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.514987  normal  0.0153683 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0020  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.789057  hitchhiker  0.000213663 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0030  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.480252  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0001  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0002  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0078  tRNA-Lys  87.88 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.561657  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0050  tRNA-Lys  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0021  tRNA-Lys  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0163136  normal  0.708975 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0062  tRNA-Lys  89.66 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.100557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0063  tRNA-Lys  89.66 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.109202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0104  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37540  tRNA-Lys  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0863573  normal  0.917187 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0022  tRNA-Lys  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0015  tRNA-Lys  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0792154  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0023  tRNA-Lys  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.75812  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0026  tRNA-Lys  90.38 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000756326  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0031  tRNA-Lys  90.38 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.640405  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08800  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0702581  normal  0.0577684 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0021  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.682911  normal  0.0277835 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0006  tRNA-Lys  94.74 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.736835  normal  0.711036 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  94.74 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569019  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0008  tRNA-Lys  94.74 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.054171  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3259  tRNA-Lys  94.74 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0048  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1370  tRNA-Lys  94.74 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.598749  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0024  tRNA-Lys  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.330999  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0064  tRNA-Lys  87.93 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0020  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.768536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0021  tRNA-Lys  94.74 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.13563  hitchhiker  0.00625278 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0824  tRNA-Lys  94.74 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0521  tRNA-Lys  94.74 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0064  tRNA-Lys  94.74 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2658  tRNA-Lys  94.74 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0806589  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3206  tRNA-Lys  94.74 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3244  tRNA-Lys  94.74 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.489776  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1952  tRNA-Lys  94.74 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1660  tRNA-Lys  94.74 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0050  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0053  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000949911  hitchhiker  0.00166028 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0033  tRNA-Lys  86.89 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.773389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0021  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0001  tRNA-Lys  90.91 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0028  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0019  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000484995  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0071  tRNA-Lys  92.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.641081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0021  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000445205  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0044  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0043  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.438786  normal  0.486369 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0022  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.462625  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0027  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0021  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0223397 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33730  tRNA-Lys  92.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0061  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 72 bp  54  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0024  tRNA-Gln  88.24 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000359356  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0078  tRNA-Asn  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0038  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0059  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0049  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0048  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0727081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24780  tRNA-Lys  90.7 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.190914  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0023  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0005  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 73 bp  54  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0007  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0167892  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06840  tRNA-Lys  94.29 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0017  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0002  tRNA-Lys  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0004  tRNA-Lys  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.912706  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0031  tRNA-Lys  92.11 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0035  tRNA-Lys  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0379309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0036  tRNA-Lys  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0360191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0037  tRNA-Lys  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00809358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0043  tRNA-Lys  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.465009  normal  0.488782 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0036  tRNA-Lys  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.415695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0023  tRNA-Lys  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0320395 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0010  tRNA-Lys  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0028  tRNA-Lys  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.196186  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>