50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aazo_R0021 on replicon NC_014248
Organism: 'Nostoc azollae' 0708



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_R0021  tRNA-Lys  100 
 
 
72 bp  143  6e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0023  tRNA-Lys  91.67 
 
 
72 bp  95.6  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.35633 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0033  tRNA-Lys  91.53 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0004  tRNA-Lys  88.33 
 
 
72 bp  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0763324 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0005  tRNA-Lys  88.33 
 
 
72 bp  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0018  tRNA-Lys  88.14 
 
 
72 bp  61.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0038  tRNA-Lys  88.14 
 
 
72 bp  61.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.227517 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0546  tRNA-Lys  100 
 
 
78 bp  61.9  0.00000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00878444  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNALysVIMSS1309168  tRNA-Lys  88.14 
 
 
72 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.148138  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNALysVIMSS1309127  tRNA-Lys  88.14 
 
 
72 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNALysVIMSS1309093  tRNA-Lys  88.14 
 
 
72 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0010  tRNA-Lys  92.31 
 
 
75 bp  54  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00461477  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0009  tRNA-Lys  86.44 
 
 
72 bp  54  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNALysVIMSS1309373  tRNA-Lys  86.44 
 
 
72 bp  54  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.589902  normal  0.683475 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0029  tRNA-Lys  96.77 
 
 
76 bp  54  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0032  tRNA-Lys  96.77 
 
 
76 bp  54  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000262345  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0030  tRNA-Lys  96.77 
 
 
76 bp  54  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.407731  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0033  tRNA-Lys  96.77 
 
 
76 bp  54  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.177696  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0009  tRNA-Lys  89.36 
 
 
76 bp  54  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.269923  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNALysVIMSS1309193  tRNA-Lys  86.44 
 
 
72 bp  54  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.238079  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0027  tRNA-Lys  92.31 
 
 
72 bp  54  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.685888 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0025  tRNA-Lys  86.44 
 
 
72 bp  54  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.810895  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0037  tRNA-Lys  88 
 
 
75 bp  52  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0055  tRNA-Lys  96.67 
 
 
73 bp  52  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.429653  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0030  tRNA-Lys  92.68 
 
 
73 bp  50.1  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.480252  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05871  hypothetical protein  87.76 
 
 
432 bp  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.791766  normal  0.721442 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0036  tRNA-Lys  93.94 
 
 
75 bp  50.1  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0020  tRNA-Lys  88.46 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.405575 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08480  tRNA-Lys  88.46 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0822339  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0046  tRNA-Lys  88.46 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0640461  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0021  tRNA-Lys  88.46 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0051  tRNA-Lys  87.23 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0146839  normal  0.022056 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0015  tRNA-Lys  87.23 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24780  tRNA-Lys  91.43 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.190914  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0049  tRNA-Lys  87.23 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.858771  hitchhiker  0.000592487 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0051  tRNA-Lys  86.27 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.106867  normal  0.0466921 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0083  tRNA-Lys  93.33 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0040  tRNA-Lys  86.96 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0082  tRNA-Lys  93.33 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0048  tRNA-Lys  93.33 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0081  tRNA-Lys  93.33 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0010  tRNA-Met  87.04 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.538591  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0054  tRNA-Lys  96.15 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0043  tRNA-Lys  93.33 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0523959 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0021  tRNA-Lys  89.47 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.682911  normal  0.0277835 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0045  tRNA-Met  90.48 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0035  tRNA-Lys  86.96 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.292449  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0021  tRNA-Lys  89.47 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0042  tRNA-Met  87.04 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0061  tRNA-Lys  85.19 
 
 
72 bp  44.1  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>