209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene tRNA-Asn-1 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.513289  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4299  tRNA-Asn  92.98 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0018  tRNA-Asn  92.98 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.224402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0028  tRNA-Asn  92.98 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.227518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0026  tRNA-Asn  92.98 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.294588 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0032  tRNA-Asn  92.98 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0046  tRNA-Asn  92.98 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6038  tRNA-Asn  92.98 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000594197  hitchhiker  0.00000000000000771476 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0014  tRNA-Asn  91.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.566187  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0036  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2221  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2267  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0500335  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0005  tRNA-Asn  90.38 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.404272  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0052  tRNA-Asn  90.38 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0029  tRNA-Asn  90.38 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0028  tRNA-Asn  90.38 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246384  normal  0.65431 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1454  tRNA-Asn  86.11 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAAsnVIMSS1309287  tRNA-Asn  90.38 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.781392 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA44  tRNA-Asn  90.38 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.366326  normal  0.398045 
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  87.93 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1748  tRNA-Asn  87.93 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0531  tRNA-Asn  87.93 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0500  tRNA-Asn  87.93 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00327724  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0026  tRNA-Asn  88.68 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000338371  normal  0.10818 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0045  tRNA-Asn  88.68 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000031214  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0020  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.454268  normal  0.255497 
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  88.46 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0034    88.46 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.025116  hitchhiker  0.0090759 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0003  tRNA-Asn  88.46 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.173284  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0025  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.728693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0005  tRNA-Met  89.29 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.245348 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAAsnVIMSS1309105  tRNA-Asn  88.46 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.512806  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAAsnVIMSS1309137  tRNA-Asn  88.46 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.898434  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAAsnVIMSS1309178  tRNA-Asn  88.46 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0024  tRNA-Asn  88.46 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0005  tRNA-Lys  92.31 
 
 		 72 bp  54  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0009  tRNA-Lys  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.66226  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0004  tRNA-Lys  92.31 
 
 		 72 bp  54  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0763324 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0008  tRNA-Asn  88.24 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0044  tRNA-Lys  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000117241  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0043  tRNA-Lys  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000106008  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0060  tRNA-Lys  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00703391  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0061  tRNA-Lys  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00295696  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0042  tRNA-Lys  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000110387  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0048  tRNA-Lys  92.11 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0029  tRNA-Met  88.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4590  tRNA-Asn  93.94 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0071  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0020  tRNA-Asn  93.94 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0942184 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0024  tRNA-Met  87.76 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0020  tRNA-Asn  93.94 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2046  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000370287  hitchhiker  0.00336958 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4239  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00412423  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0045  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.315592  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0052  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0175495  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0004  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.21987  normal  0.244967 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0060  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000424402  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0047  tRNA-Asn  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0440889 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0037  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.813487  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_BR0007  tRNA-Met  87.5 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.849736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLys01  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 79 bp  48.1  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000157886  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLys02  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 79 bp  48.1  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000433132  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLys03  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 79 bp  48.1  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00045675  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0008  tRNA-Asn  86.54 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0028  tRNA-Phe  88.46 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000645799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_R0078  tRNA-Met  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0983896 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0593  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  8.55159e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R08  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0037  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000219335  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0036  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000208543  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0061  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000433074  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0055  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.444968  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0763  tRNA-Asn  83.33 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.366453  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1414  tRNA-Asn  83.33 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.906421  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0034  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.130491  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0061  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00534355  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0059  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000364263  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0060  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000089379  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0032  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_R0078  tRNA-Met  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.105047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0033  tRNA-Met  86.54 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0049  tRNA-Lys  90.7 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.858771  hitchhiker  0.000592487 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0027  tRNA-Lys  89.74 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.685888 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0035  tRNA-Met  96.3 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000027338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0038  tRNA-Met  89.74 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0167531  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0023  tRNA-Lys  86.27 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000728017  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0024  tRNA-Lys  86.27 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000367183  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0025  tRNA-Lys  86.27 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000379634  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t1934  tRNA-Lys  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.810073  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0015  tRNA-Lys  90.7 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00017  tRNA-Lys  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000192994  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00021  tRNA-Lys  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000923528  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00044  tRNA-Lys  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000150882  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0058  tRNA-Lys  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188503  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0060  tRNA-Lys  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.42893e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0006  tRNA-Lys  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.276121  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0458  tRNA-Lys  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0024  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0077208  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0025  tRNA-Asn  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0039  tRNA-Lys  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>