61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_R0027 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_R0027  tRNA-Lys  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.685888 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0004  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0763324 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0005  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0004  tRNA-Lys  93.62 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.21987  normal  0.244967 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0027  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0021  tRNA-Lys  92.31 
 
 		 72 bp  54  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0021  tRNA-Lys  92.31 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0045  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00000955688  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0036  tRNA-Lys  93.94 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0009  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.66226  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0020  tRNA-Lys  93.75 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.454268  normal  0.255497 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0023  tRNA-Lys  83.33 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.35633 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0013  tRNA-Met  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0026  tRNA-Asn  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.294588 
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  89.74 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.513289  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0045  tRNA-Lys  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.315592  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4299  tRNA-Asn  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0052  tRNA-Lys  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0175495  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0049  tRNA-Met  87.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.404758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0018  tRNA-Asn  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.224402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0028  tRNA-Asn  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.227518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0071  tRNA-Lys  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2046  tRNA-Lys  89.74 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000370287  hitchhiker  0.00336958 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6038  tRNA-Asn  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000594197  hitchhiker  0.00000000000000771476 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0032  tRNA-Asn  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0046  tRNA-Asn  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4239  tRNA-Lys  89.74 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00412423  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0061  tRNA-Lys  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00534355  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0055  tRNA-Lys  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.444968  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0037  tRNA-Lys  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.813487  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0047  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.157742  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0060  tRNA-Lys  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000424402  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0061  tRNA-Lys  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000433074  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0036  tRNA-Lys  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000208543  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0037  tRNA-Lys  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000219335  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4250  tRNA-Lys  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000179224  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0035  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0018  tRNA-Lys  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000646357  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0034  tRNA-Lys  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.130491  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4226  tRNA-Lys  86.96 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108643  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0059  tRNA-Lys  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000364263  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0060  tRNA-Lys  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000089379  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2736  tRNA-Lys  86.96 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000214586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1400  tRNA-Lys  86.96 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00524928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0062  tRNA-Lys  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000012796  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0032  tRNA-Lys  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0006  tRNA-Lys  91.18 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.400003  normal  0.202736 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4251  tRNA-Lys  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000189937  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4252  tRNA-Lys  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000173353  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4253  tRNA-Lys  86.96 
 
 		 78 bp  44.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  4.87819e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0049  tRNA-Lys  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000590411  decreased coverage  0.00000280751 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0075  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0051  tRNA-Lys  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000619589  hitchhiker  0.0000190999 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0052  tRNA-Lys  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000683016  hitchhiker  0.000091513 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0593  tRNA-Lys  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  8.55159e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0053  tRNA-Lys  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000619589  hitchhiker  0.0000900565 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0080  tRNA-Lys  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000294531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0065  tRNA-Lys  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000124878  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0064  tRNA-Lys  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000141775  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0063  tRNA-Lys  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>