206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_R0027 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_R0027  tRNA-Lys  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.968088 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0034  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 78 bp  123  6e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0021  tRNA-Lys  96 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.360576 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0008  tRNA-Lys  94.87 
 
 		 78 bp  115  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0194876  normal  0.882608 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_10  tRNA-Lys  100 
 
 		 93 bp  111  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0012  tRNA-Arg  93.59 
 
 		 78 bp  107  4e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0001  tRNA-Arg  91.14 
 
 		 79 bp  95.6  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.651067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0003  tRNA-Arg  91.03 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.79204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0025  tRNA-Arg  91.03 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.954082 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0026  tRNA-Lys  97.87 
 
 		 101 bp  85.7  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.371557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0026  tRNA-OTHER  97.87 
 
 		 101 bp  85.7  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0012  tRNA-Lys  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.711012  normal  0.109612 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_4  tRNA-Lys  94.83 
 
 		 94 bp  83.8  0.000000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0532674 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0036  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.633015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0036  tRNA-OTHER  100 
 
 		 99 bp  75.8  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0011  tRNA-OTHER  100 
 
 		 119 bp  73.8  0.000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0032  tRNA-Trp  87.67 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.262491 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0024  tRNA-OTHER  100 
 
 		 101 bp  73.8  0.000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0035  tRNA-Asn  95.56 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0034  tRNA-Arg  87.18 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0010  tRNA-Lys  95.12 
 
 		 97 bp  65.9  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0012  tRNA-Trp  87.69 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.146642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0013  tRNA-OTHER  97.3 
 
 		 101 bp  65.9  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_7  tRNA-Arg  91.23 
 
 		 94 bp  65.9  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.010437 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0013  tRNA-Trp  86.3 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0037  tRNA-Asn  90.16 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0005  tRNA-OTHER  97.3 
 
 		 98 bp  65.9  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0001  tRNA-OTHER  97.14 
 
 		 98 bp  61.9  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0811775 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0024  tRNA-OTHER  97.06 
 
 		 98 bp  60  0.00000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0359457 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0028  tRNA-OTHER  97.06 
 
 		 95 bp  60  0.00000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000246213 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0032  tRNA-Met  94.74 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0011  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 96 bp  58  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.935376  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0033  tRNA-OTHER  94.59 
 
 		 98 bp  58  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_3  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 94 bp  58  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0252  tRNA-Met  86.67 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0006  tRNA-Trp  86.67 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.576658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0029  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0017  tRNA-Arg  85.07 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0028  tRNA-Met  88.24 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0020  tRNA-Leu  89.36 
 
 		 98 bp  54  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.06804  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_5  tRNA-Asn  93.02 
 
 		 111 bp  54  0.000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAArgVIMSS1309273  tRNA-Arg  86.21 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0052  tRNA-Met  85.14 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0055  tRNA-Arg  84.06 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000044342  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0039  tRNA-Ile  100 
 
 		 92 bp  50.1  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0027  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000236545  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0023  tRNA-Arg  91.89 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0042  tRNA-Met  83.56 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.935118  normal  0.310323 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0043  tRNA-Met  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.259921  normal  0.901297 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0058  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_6  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 94 bp  50.1  0.00008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0011  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 92 bp  50.1  0.00008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.597618  normal  0.106894 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0042  tRNA-Met  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0055  tRNA-Met  86.79 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0266099  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0021  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 104 bp  50.1  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.212228 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0010  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  50.1  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.332362  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS01505  tRNA-Met  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.946328  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01580  tRNA-Cys  100 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01590  tRNA-Cys  100 
 
 		 91 bp  48.1  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAArgVIMSS1309070  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0009  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0043  tRNA-Met  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0039  tRNA-Met  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0034  tRNA-Met  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00052  tRNA-Met  86.27 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00053  tRNA-Met  86.27 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00057  tRNA-Met  86.27 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0017  tRNA-Met  86.27 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.687744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0018  tRNA-Met  86.27 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.701161  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0019  tRNA-Met  86.27 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.69794  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t21  tRNA-Met  86.27 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.929241  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t22  tRNA-Met  86.27 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lppt41  tRNA-Met  86.27 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0089  tRNA-Met  91.43 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014219  hitchhiker  0.00718403 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0009  tRNA-Arg  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.122464  normal  0.0281964 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0046  tRNA-Met  86.27 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.918384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0008  tRNA-Arg  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0006  tRNA-Arg  87.23 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0082  tRNA-Met  86.27 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0045  tRNA-Met  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.207036  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0061  tRNA-Met  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3226  tRNA-Met  86.27 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0172509  normal  0.439997 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0019  tRNA-Met  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000306016 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0020  tRNA-Met  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000296259 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0022  tRNA-Met  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030404 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0023  tRNA-Met  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00031593 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4212  tRNA-Met  86.27 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.353774  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4213  tRNA-Met  86.27 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.355481  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4214  tRNA-Met  86.27 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4276  tRNA-Met  86.27 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000119762  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00106  tRNA-Met  86.27 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00110  tRNA-Met  86.27 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4693  tRNA-Met  86.27 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.83874  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4694  tRNA-Met  86.27 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4695  tRNA-Met  86.27 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4696  tRNA-Met  86.27 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4700  tRNA-Met  86.27 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00322718  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5064  tRNA-Met  86.27 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.133339  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5065  tRNA-Met  86.27 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.133786  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5066  tRNA-Met  86.27 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.126908  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>