27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_R0021 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_R0021  tRNA-Arg  100 
 
 		 104 bp  206  8e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.212228 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0027  tRNA-Arg  84.62 
 
 		 104 bp  79.8  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0030  tRNA-Arg  97.5 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0001  tRNA-Arg  95 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0045  tRNA-Arg  95 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.249789 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0058  tRNA-Arg  94.12 
 
 		 78 bp  52  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0026  tRNA-OTHER  96.55 
 
 		 101 bp  50.1  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0036  tRNA-OTHER  96.55 
 
 		 99 bp  50.1  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0026  tRNA-Lys  96.55 
 
 		 101 bp  50.1  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.371557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0024  tRNA-OTHER  96.55 
 
 		 101 bp  50.1  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0036  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 78 bp  50.1  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.633015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0021  tRNA-Lys  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.360576 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0011  tRNA-OTHER  96.55 
 
 		 119 bp  50.1  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0034  tRNA-Lys  96.55 
 
 		 78 bp  50.1  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0027  tRNA-Lys  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.968088 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0025  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 78 bp  50.1  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.954082 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0012  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 78 bp  50.1  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0038  tRNA-Ser  96.43 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0029  tRNA-Met  96.43 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0010  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.332362  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0009  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  46.1  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0041  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0008  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0032  tRNA-Met  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0079  tRNA-OTHER  100 
 
 		 121 bp  44.1  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0009  tRNA-Lys  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.000488659  normal  0.0708326 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0024  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 90 bp  44.1  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.771773  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>