299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_R0043 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_R0043  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0039  tRNA-Met  98.65 
 
 		 74 bp  131  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0045  tRNA-Met  97.3 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00820009  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0012  tRNA-Met  94.29 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000000664581  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0061  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0047  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0028  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0005  tRNA-Met  92.96 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.208114  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0083  tRNA-Met  92.96 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0025  tRNA-Met  92.96 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt41  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt41  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0080  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00406069  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2792  tRNA-Met  92.96 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000935283  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2795  tRNA-Met  92.96 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000169803  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2478  tRNA-Met  92.96 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00948036  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2481  tRNA-Met  92.96 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000303707  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0042  tRNA-Met  92.96 
 
 		 76 bp  101  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00068414  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0002  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0068  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0035  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.575749  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26130  tRNA-Met  92.86 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0016  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0676778  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0017  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0089  tRNA-Met  92.86 
 
 		 76 bp  99.6  9e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000014219  hitchhiker  0.00718403 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0046  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.918384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0082  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0088  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0002  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.287146 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna34  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.775098  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0016  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.69639  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0069  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0046  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.363544  normal  0.0435272 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0043  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0023  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.247152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0005  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0014  tRNA-Met  93.24 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0050  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.540362  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0053  tRNA-Met  93.15 
 
 		 72 bp  97.6  4e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00052  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00053  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0017  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.687744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0018  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.701161  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t71  tRNA-Met  93.06 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0872657  hitchhiker  0.00727048 
 
 
-
 
NC_003295  RS03939  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS03940  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3227  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0186102  normal  0.434912 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0088  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0282515  hitchhiker  0.000000388022 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0105  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0093247  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t022  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00104  tRNA-Met  93.06 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4213  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.355481  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-4  tRNA-Met  93.06 
 
 		 80 bp  95.6  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00179817  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0127  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00272429  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0078  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000612862  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0026  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116452  normal  0.378312 
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-5  tRNA-Met  93.06 
 
 		 80 bp  95.6  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.996221  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4696  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00108  tRNA-Met  93.06 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3990  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000448395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3226  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0172509  normal  0.439997 
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-5  tRNA-Met  93.06 
 
 		 80 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000520832  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5066  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.126908  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4214  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0020  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0021  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3467  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.139541  normal  0.865403 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2957  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.220059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0013  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.474812  normal  0.0245771 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R19  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000168289  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5064  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.133339  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5071  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.102189  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-6  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00021362  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4700  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00322718  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0030  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0121  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000952956  decreased coverage  0.0000866797 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0019  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0010  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00010521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0094  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0081  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0699076  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0080  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0693639  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tMet01  tRNA-Met  93.06 
 
 		 80 bp  95.6  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0040  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000251493  hitchhiker  0.0001025 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0041  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000296842  normal  0.054295 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2747  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000177551  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0171  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761498  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0064  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2750  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  3.88112e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62790  tRNA-Met  93.06 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0039  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00627079  hitchhiker  0.0000321051 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0097  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000407558  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0036  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.119632  normal  0.136959 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0081  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0120643  normal  0.12492 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2751  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  4.74519e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0013  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000085866 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4212  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.353774  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0104  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000123497  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4693  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.83874  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5065  tRNA-Met  93.06 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.133786  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03399  tRNA-Met  93.06 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>