More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_R0045 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_R0045  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00820009  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0039  tRNA-Met  98.65 
 
 		 74 bp  139  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0047  tRNA-Met  97.26 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0043  tRNA-Met  97.3 
 
 		 76 bp  123  6e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0068  tRNA-Met  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0002  tRNA-Met  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0035  tRNA-Met  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.575749  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0023  tRNA-Met  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.247152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0014  tRNA-Met  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna34  tRNA-Met  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.775098  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0069  tRNA-Met  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0088  tRNA-Met  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0002  tRNA-Met  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.287146 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0046  tRNA-Met  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.363544  normal  0.0435272 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0005  tRNA-Met  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0043  tRNA-Met  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0016  tRNA-Met  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.69639  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0016  tRNA-Met  95.89 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0676778  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60370  tRNA-Met  95.83 
 
 		 74 bp  119  9e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0113  tRNA-Met  95.83 
 
 		 77 bp  119  9e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000187631  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0127  tRNA-Met  95.83 
 
 		 77 bp  119  9e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00272429  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS03939  tRNA-Met  95.83 
 
 		 77 bp  119  9e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS03940  tRNA-Met  95.83 
 
 		 77 bp  119  9e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5720  tRNA-Met  95.83 
 
 		 77 bp  119  9e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0159176  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0078  tRNA-Met  95.83 
 
 		 77 bp  119  9e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000612862  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0042  tRNA-Met  95.83 
 
 		 77 bp  119  9e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-4  tRNA-Met  95.83 
 
 		 80 bp  119  9e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00179817  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-5  tRNA-Met  95.83 
 
 		 80 bp  119  9e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.996221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-5  tRNA-Met  95.83 
 
 		 80 bp  119  9e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000520832  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0057  tRNA-Met  95.83 
 
 		 77 bp  119  9e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R19  tRNA-Met  95.83 
 
 		 77 bp  119  9e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000168289  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60270  tRNA-Met  95.83 
 
 		 74 bp  119  9e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0056  tRNA-Met  95.83 
 
 		 77 bp  119  9e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0064  tRNA-Met  95.83 
 
 		 77 bp  119  9e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5022  tRNA-Met  95.83 
 
 		 79 bp  119  9e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00192595  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-6  tRNA-Met  95.83 
 
 		 77 bp  119  9e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00021362  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0026  tRNA-Met  95.83 
 
 		 77 bp  119  9e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0368817  normal  0.25242 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0010  tRNA-Met  95.83 
 
 		 77 bp  119  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00010521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4991  tRNA-Met  95.83 
 
 		 79 bp  119  9e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0105  tRNA-Met  95.83 
 
 		 77 bp  119  9e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0093247  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5465  tRNA-Met  95.83 
 
 		 77 bp  119  9e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.239722  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0073  tRNA-Met  95.83 
 
 		 77 bp  119  9e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0076  tRNA-Met  95.83 
 
 		 77 bp  119  9e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0262196  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62790  tRNA-Met  95.83 
 
 		 74 bp  119  9e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0027  tRNA-Met  95.83 
 
 		 77 bp  119  9e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0686525  normal  0.260083 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0052  tRNA-Met  95.83 
 
 		 77 bp  119  9e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0858392  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0023  tRNA-Met  95.83 
 
 		 77 bp  119  9e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205789  normal  0.0373381 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0022  tRNA-Met  95.83 
 
 		 77 bp  119  9e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.136375  normal  0.0369046 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0041  tRNA-Met  95.77 
 
 		 77 bp  117  3.9999999999999997e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0831228  normal  0.361197 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0023  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.216301  normal  0.182837 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Met-2  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt41  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt41  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0049  tRNA-Met  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0512381 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0046  tRNA-Met  94.52 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.918384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0082  tRNA-Met  94.52 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0034  tRNA-Met  94.52 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0131764 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0061  tRNA-Met  94.52 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00052  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00053  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2955  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.14009  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0017  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.687744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0018  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.701161  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0026  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116452  normal  0.378312 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0013  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0557998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0021  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3202  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.148125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3183  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA63  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.779094 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0022  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000159989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0042  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000238456  normal  0.634383 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0125  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000166673  hitchhiker  0.000558782 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0082  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0688432  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0081  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0699076  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0052  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00733518  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0145  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000566193  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0019  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0039  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0091  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000136537  hitchhiker  0.00304334 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0034  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3661  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.677335  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0030  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0034  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0865179  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0013  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.105797  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3547  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.226089  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0030  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00091315  normal  0.388606 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3201  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.145985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5071  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.102189  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3226  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0172509  normal  0.439997 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0088  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0282515  hitchhiker  0.000000388022 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3990  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000448395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3227  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0186102  normal  0.434912 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0080  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0693639  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0020  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0013  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000085866 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2956  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.211186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3152  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.469971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0117  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.214909  hitchhiker  0.0000036975 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2957  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.220059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3185  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>