More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_R0030 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_R0020  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.798024  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0030  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0020  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0013  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.474812  normal  0.0245771 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0050  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  143  7e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.540362  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0056  tRNA-Met  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0042  tRNA-Met  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0113  tRNA-Met  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000187631  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0076  tRNA-Met  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0262196  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0010  tRNA-Met  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000000563126  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0073  tRNA-Met  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0012  tRNA-Met  98.68 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000000664581  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0043  tRNA-Met  97.37 
 
 
77 bp  135  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0865  tRNA-Met  96.1 
 
 
79 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000813952  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0790  tRNA-Met  96.1 
 
 
79 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3991e-32 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5710  tRNA-Met  96.1 
 
 
79 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000091391  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0604  tRNA-Met  96.1 
 
 
79 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000969852  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS03939  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RS03940  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5667  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5675  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000376256  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5699  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000350684  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5720  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0159176  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0023  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205789  normal  0.0373381 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4773  tRNA-Met  96.1 
 
 
79 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000665438  hitchhiker  6.54659e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0282  tRNA-Met  96.1 
 
 
79 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-2  tRNA-Met  96.1 
 
 
80 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0182265  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-4  tRNA-Met  96.1 
 
 
80 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00179817  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-7  tRNA-Met  96.1 
 
 
80 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-3  tRNA-Met  96.1 
 
 
80 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00436106  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-4  tRNA-Met  96.1 
 
 
80 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-5  tRNA-Met  96.1 
 
 
80 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.996221  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-6  tRNA-Met  96.1 
 
 
80 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00001255  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-2  tRNA-Met  96.1 
 
 
80 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0383767  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-3  tRNA-Met  96.1 
 
 
80 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000267735  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-5  tRNA-Met  96.1 
 
 
80 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000520832  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-8  tRNA-Met  96.1 
 
 
80 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt41  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt41  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0024  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000157655  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-2  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.527253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-4  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000768608  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-6  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00021362  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0048  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.459863  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0054  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0060  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0010  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00010521  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0022  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.136375  normal  0.0369046 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0043  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.399945  normal  0.221378 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0069  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0052  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0858392  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5022  tRNA-Met  96.1 
 
 
79 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00192595  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0306  tRNA-Met  96.1 
 
 
79 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5678  tRNA-Met  96.1 
 
 
79 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.015213  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5807  tRNA-Met  96.1 
 
 
79 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00231597  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5737  tRNA-Met  96.1 
 
 
79 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000112746  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5667  tRNA-Met  96.1 
 
 
79 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000879492  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4991  tRNA-Met  96.1 
 
 
79 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0529  tRNA-Met  96.1 
 
 
79 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.1797900000000004e-29 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0064  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0068  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0026  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0368817  normal  0.25242 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0027  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0686525  normal  0.260083 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0023  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000339625  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0057  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0078  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000612862  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0105  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0093247  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0127  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00272429  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0025  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.279282  normal  0.0688605 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0047  tRNA-Met  96.05 
 
 
77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00052  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00053  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0017  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.687744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0018  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.701161  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0046  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000150428  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRAt12  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-3  tRNA-Met  94.81 
 
 
80 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000174152  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0081  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000214937  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0030  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00091315  normal  0.388606 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0031  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-3  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000104946  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0034  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0009  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0023  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0041  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0263  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1081  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.599791  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0059  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0015  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0059  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4212  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.353774  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4213  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.355481  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4214  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4276  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000119762  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4693  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.83874  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5071  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.102189  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5066  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.126908  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4696  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4700  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00322718  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5064  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.133339  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>