More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_R0013 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_R0052  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0029  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000365135 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0013  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.105797  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0039  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0062  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5720  tRNA-Met  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0159176  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0060  tRNA-Met  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189075  normal 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-4  tRNA-Met  98.7 
 
 
80 bp  145  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00179817  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-5  tRNA-Met  98.7 
 
 
80 bp  145  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.996221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-5  tRNA-Met  98.7 
 
 
80 bp  145  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000520832  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4991  tRNA-Met  98.7 
 
 
79 bp  145  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-6  tRNA-Met  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00021362  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0127  tRNA-Met  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00272429  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0105  tRNA-Met  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0093247  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0090  tRNA-Met  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.419074  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0057  tRNA-Met  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0058  tRNA-Met  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263555  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0078  tRNA-Met  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000612862  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5022  tRNA-Met  98.7 
 
 
79 bp  145  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00192595  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Met-2  tRNA-Met  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0970138  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0036  tRNA-Met  98.63 
 
 
77 bp  137  4e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.465493  normal  0.444935 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0024  tRNA-Met  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0058  tRNA-Met  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000407746  normal  0.446811 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0042  tRNA-Met  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0290864  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0014  tRNA-Met  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0018085  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0006  tRNA-Met  97.4 
 
 
77 bp  137  4e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.0000000000568844  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0064  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RS03939  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RS03940  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5049  tRNA-Met  96.1 
 
 
79 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000236234  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5037  tRNA-Met  96.1 
 
 
79 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.794581  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0026  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0368817  normal  0.25242 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0113  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000187631  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0082  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000739583  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0081  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000214937  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0042  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0076  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0262196  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0046  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000150428  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0057  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000630751  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0224  tRNA-Met  96.1 
 
 
79 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000093753  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4566  tRNA-Met  96.1 
 
 
79 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000236234  normal  0.0841904 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0010  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00010521  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0023  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.205789  normal  0.0373381 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0027  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0686525  normal  0.260083 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0022  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.136375  normal  0.0369046 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0070  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0070  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.734677  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0071  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.957172  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0131  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.14207  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0073  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0056  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0052  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0858392  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0005  tRNA-Met  96.05 
 
 
77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0047  tRNA-Met  96.05 
 
 
77 bp  127  4.0000000000000003e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0009  tRNA-Met  95.95 
 
 
74 bp  123  6e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1572  tRNA-Met  95.95 
 
 
74 bp  123  6e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1607  tRNA-Met  95.95 
 
 
74 bp  123  6e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.836309 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0039  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0013  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.474812  normal  0.0245771 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0043  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0058  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.547375 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4773  tRNA-Met  94.81 
 
 
79 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000665438  hitchhiker  6.54659e-16 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0069  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00149713  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0048  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.816962 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5667  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5675  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000376256  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5699  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000350684  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-7  tRNA-Met  94.81 
 
 
80 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-3  tRNA-Met  94.81 
 
 
80 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00436106  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-4  tRNA-Met  94.81 
 
 
80 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-6  tRNA-Met  94.81 
 
 
80 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00001255  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-2  tRNA-Met  94.81 
 
 
80 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0383767  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-3  tRNA-Met  94.81 
 
 
80 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000267735  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-8  tRNA-Met  94.81 
 
 
80 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5807  tRNA-Met  94.81 
 
 
79 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00231597  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5710  tRNA-Met  94.81 
 
 
79 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000091391  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0020  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.798024  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0013  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0557998  normal 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-2  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.527253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-4  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000768608  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0020  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0034  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0306  tRNA-Met  94.81 
 
 
79 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5667  tRNA-Met  94.81 
 
 
79 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000879492  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0030  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5678  tRNA-Met  94.81 
 
 
79 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.015213  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5737  tRNA-Met  94.81 
 
 
79 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000112746  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0030  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00091315  normal  0.388606 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_R0079  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0014  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0075  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.323397 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0010  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0790  tRNA-Met  94.81 
 
 
79 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3991e-32 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0003  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0223244  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0022  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000159989  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0529  tRNA-Met  94.81 
 
 
79 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.1797900000000004e-29 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0282  tRNA-Met  94.81 
 
 
79 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0031  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0026  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0865  tRNA-Met  94.81 
 
 
79 bp  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000813952  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>