More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2481 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2792  tRNA-Met  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000935283  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2795  tRNA-Met  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000169803  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2478  tRNA-Met  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00948036  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2481  tRNA-Met  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000303707  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0014  tRNA-Met  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000138583  hitchhiker  0.00843441 
 
 
-
 
NC_006055  Mflt019  tRNA-Met  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00289748  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0229  tRNA-Met  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0489  tRNA-Met  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.107964  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0228  tRNA-Met  97.37 
 
 
76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.883109  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0064  tRNA-Met  97.4 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0068  tRNA-Met  97.4 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0074  tRNA-Met  96.05 
 
 
76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0141721  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0048  tRNA-Met  96.05 
 
 
76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00409102  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0025  tRNA-Met  96.05 
 
 
76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0007  tRNA-Met  96.05 
 
 
76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.269923  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0026  tRNA-Met  96.05 
 
 
76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  6.52648e-26  unclonable  0.0000000488908 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0014  tRNA-Met  96.05 
 
 
76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0042  tRNA-Met  96.05 
 
 
76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.324618  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0086  tRNA-Met  96.05 
 
 
76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0019  tRNA-Met  96.05 
 
 
76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0324694  normal  0.0212218 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0024  tRNA-Met  96.05 
 
 
76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0898053 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0473  tRNA-Met  96.05 
 
 
76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0012  tRNA-Met  96 
 
 
76 bp  125  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000000664581  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0039  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt41  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt41  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0042  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000238456  normal  0.634383 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0014  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0080  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00406069  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0034  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0043  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.399945  normal  0.221378 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0069  tRNA-Met  96.1 
 
 
77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0005  tRNA-Met  94.74 
 
 
76 bp  119  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.208114  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0083  tRNA-Met  94.74 
 
 
76 bp  119  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0041  tRNA-Met  96.05 
 
 
77 bp  119  9.999999999999999e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0831228  normal  0.361197 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0042  tRNA-Met  94.74 
 
 
76 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00068414  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0093  tRNA-Met  94.74 
 
 
76 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0094  tRNA-Met  94.74 
 
 
76 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0095  tRNA-Met  94.74 
 
 
76 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0096  tRNA-Met  94.74 
 
 
76 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0097  tRNA-Met  94.74 
 
 
76 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00052  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  113  6e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00053  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  113  6e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00057  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  113  6e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0017  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  113  6e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.687744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0018  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  113  6e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.701161  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0019  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  113  6e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.69794  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2751  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  113  6e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  4.74519e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Met-2  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  113  6e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS03939  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  113  6e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RS03940  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  113  6e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0024  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  113  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0236841  normal  0.117231 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2677  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  113  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0104  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  113  6e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000123497  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2750  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  113  6e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  3.88112e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0073  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  113  6e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000821998  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t022  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  113  6e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0063  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  113  6e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00364456  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1510  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  113  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.268798  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-4  tRNA-Met  94.81 
 
 
80 bp  113  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00179817  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1829  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  113  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0171  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  113  6e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761498  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0025  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  113  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0370437  normal  0.116281 
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-5  tRNA-Met  94.81 
 
 
80 bp  113  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.996221  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0097  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  113  6e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000407558  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Met-3  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  113  6e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Met-4  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  113  6e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0772  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  113  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244521  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1982  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  113  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2752  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  113  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R19  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  113  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000168289  normal  0.0484178 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2621  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  113  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0112  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  113  6e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000290991  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0057  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  113  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0081  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  113  6e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0120643  normal  0.12492 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0031  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  113  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1813  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  113  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0390  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  113  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-6  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  113  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00021362  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1857  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  113  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2507  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  113  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0030  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  113  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0034  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  113  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.544535 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0047  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  113  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.808514  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0031  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0043  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0031  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  113  6e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0030  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  113  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00091315  normal  0.388606 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0037  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  113  6e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tMet01  tRNA-Met  94.81 
 
 
80 bp  113  6e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0040  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  113  6e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000251493  hitchhiker  0.0001025 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0041  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  113  6e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000296842  normal  0.054295 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0046  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  113  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0060  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  113  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0094  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  113  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19946  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0044  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.3828  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0068  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0039  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  113  6e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00627079  hitchhiker  0.0000321051 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0036  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  113  6e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.119632  normal  0.136959 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1732  tRNA-Met  94.81 
 
 
77 bp  113  6e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>