50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_R0033 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_R0033  tRNA-OTHER  100 
 
 		 98 bp  194  3e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0005  tRNA-OTHER  95.92 
 
 		 98 bp  163  1e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0001  tRNA-OTHER  91.67 
 
 		 98 bp  127  5e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0811775 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0024  tRNA-OTHER  89.11 
 
 		 101 bp  109  1e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0028  tRNA-OTHER  89.47 
 
 		 95 bp  109  1e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000246213 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0024  tRNA-OTHER  87.76 
 
 		 98 bp  95.6  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0359457 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0003  tRNA-Arg  100 
 
 		 78 bp  91.7  3e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.79204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0013  tRNA-OTHER  86.14 
 
 		 101 bp  85.7  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0026  tRNA-Lys  86.14 
 
 		 101 bp  85.7  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.371557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0026  tRNA-OTHER  86.14 
 
 		 101 bp  85.7  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0001  tRNA-Arg  97.62 
 
 		 79 bp  75.8  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.651067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0034  tRNA-Arg  97.44 
 
 		 78 bp  69.9  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0012  tRNA-Arg  95.24 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_6  tRNA-Arg  100 
 
 		 94 bp  61.9  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_7  tRNA-Arg  100 
 
 		 94 bp  61.9  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.010437 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0025  tRNA-Arg  94.87 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.954082 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0011  tRNA-OTHER  97.37 
 
 		 119 bp  60  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0036  tRNA-Arg  94.59 
 
 		 78 bp  58  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.633015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0027  tRNA-Lys  94.59 
 
 		 77 bp  58  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.968088 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0034  tRNA-Lys  94.59 
 
 		 78 bp  58  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0008  tRNA-Lys  94.59 
 
 		 78 bp  58  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0194876  normal  0.882608 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0036  tRNA-OTHER  94.29 
 
 		 99 bp  54  0.000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0021  tRNA-Lys  94.12 
 
 		 75 bp  52  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.360576 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0001  tRNA-Arg  90.48 
 
 		 75 bp  52  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0031  tRNA-Arg  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000138998  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0025  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  50.1  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000185989  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0023  tRNA-OTHER  93.94 
 
 		 116 bp  50.1  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0046836 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0020  tRNA-Met  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0017  tRNA-Met  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0028  tRNA-Arg  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221183 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0087  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000016212  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0027  tRNA-Arg  88.64 
 
 		 79 bp  48.1  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00420774  hitchhiker  0.0000150687 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0044  tRNA-Met  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.55918  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0033  tRNA-Met  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.241393  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0006  tRNA-Ala  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1558  hypothetical protein  100 
 
 		 267 bp  48.1  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_4  tRNA-Lys  93.75 
 
 		 94 bp  48.1  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0532674 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0164  tRNA-Pro  100 
 
 		 79 bp  46.1  0.002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0024  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000441767  unclonable  9.7747e-19 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0040  tRNA-Arg  89.74 
 
 		 78 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.661464  hitchhiker  0.0000879928 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_10  tRNA-Lys  96.77 
 
 		 93 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_3  tRNA-Arg  93.55 
 
 		 94 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0030  tRNA-Val  100 
 
 		 100 bp  46.1  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.298715 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0038  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.650606  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0036  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0037  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.703384  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0016  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.625219  normal  0.104037 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0844  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 79 bp  44.1  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.998646  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0047  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 74 bp  44.1  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.271132  normal  0.595667 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0013  tRNA-Asp  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0868676 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>