29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_R0033 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_R0017  tRNA-Met  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0044  tRNA-Met  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.55918  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0033  tRNA-Met  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.241393  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0020  tRNA-Met  98.67 
 
 		 75 bp  141  3e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0036  tRNA-Met  90.67 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0029  tRNA-Met  93.1 
 
 		 75 bp  83.8  0.000000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0008  tRNA-Met  90.62 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0006  tRNA-Met  89.06 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0959756 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0016  tRNA-Met  87.5 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.562679  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0011  tRNA-Ile  89.29 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0003  tRNA-Ile  89.29 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.472682  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0039  tRNA-Ile  89.29 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0014  tRNA-Ile  89.29 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0006  tRNA-Met  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0043  tRNA-Met  86.67 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.22018 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0065  tRNA-Met  85.33 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466048  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0041  tRNA-Met  93.62 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000000608957  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0043  tRNA-Met  92.68 
 
 		 106 bp  58  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.990562  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0012  tRNA-Ile  89.8 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00521238  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0052  tRNA-Met  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0003  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.79204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0034  tRNA-Met  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000103036  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0042  tRNA-Met  91.67 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000224763  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0639  tRNA-Met  87.5 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.000292173  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0032  tRNA-Met  84.38 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0033  tRNA-OTHER  96.43 
 
 		 98 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0024  tRNA-Ile  82.67 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0033  tRNA-Met  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Met-2  tRNA-Met  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.582141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>