10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_R0036 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_R0036  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0037  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.703384  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0096  tRNA-Arg  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.157485 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0024  tRNA-OTHER  92.31 
 
 		 98 bp  54  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0359457 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0001  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.651067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0003  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.79204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0033  tRNA-OTHER  91.18 
 
 		 98 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0057  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00400024  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0060  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1404  tRNA-Trp  85.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000898104 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>