97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_R0096 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_R0096  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.157485 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0049  tRNA-Arg  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0031  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000138998  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0024  tRNA-Arg  95.12 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.242795  normal  0.395578 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0030  tRNA-Arg  95.12 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1415  tRNA-Arg  95 
 
 		 79 bp  63.9  0.000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4261  tRNA-Arg  92.86 
 
 		 79 bp  60  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000175716  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0042  tRNA-Arg  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155325  normal  0.0810865 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1282  tRNA-Arg  92.86 
 
 		 79 bp  60  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000513688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0061  tRNA-Arg  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.204064  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0038  tRNA-Arg  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00706583  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0040  tRNA-Arg  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.435782  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0040  tRNA-Arg  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.849707  normal  0.98393 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0037  tRNA-Arg  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0044  tRNA-Arg  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0028  tRNA-Arg  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221183 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0040  tRNA-Arg  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0055  tRNA-Arg  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0025  tRNA-Arg  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0135178  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0040  tRNA-Arg  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3789  tRNA-Arg  94.74 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.966452  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0048  tRNA-Arg  92.86 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.185518  normal  0.605964 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0046  tRNA-Arg  92.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0050  tRNA-Arg  92.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000128438 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0037  tRNA-Arg  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.703384  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0036  tRNA-Arg  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0041  tRNA-Arg  92.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000701691  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0012  tRNA-Arg  94.44 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000664618  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0055  tRNA-Arg  92.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000183529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0036  tRNA-Arg  94.44 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.224199 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0638  tRNA-Arg  94.12 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.737204  normal  0.415915 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0600  tRNA-Arg  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.775158  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0602  tRNA-Arg  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.921994  normal  0.0915325 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4647  tRNA-Arg  94.12 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.695666  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5013  tRNA-Arg  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0599  tRNA-Arg  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000676837 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0664  tRNA-Arg  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.294078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0606  tRNA-Arg  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0764025 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0027  tRNA-Arg  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000775321  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0081  tRNA-Arg  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0582  tRNA-Arg  94.12 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0241  tRNA-Arg  94.12 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.628692  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0067  tRNA-Arg  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00007  tRNA-Arg  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tArg04  tRNA-Arg  90.48 
 
 		 80 bp  52  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0364203  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0924  tRNA-Arg  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.154841  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0023  tRNA-Arg  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.2030600000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_tRNA-Arg-1  tRNA-Arg  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1545  tRNA-Arg  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1514  tRNA-Arg  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1714  tRNA-Arg  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.22026  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0024  tRNA-Arg  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0065  tRNA-Arg  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000631385  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1748  tRNA-Arg  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0337298  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2749  tRNA-Arg  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1467  tRNA-Arg  90.24 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0844  tRNA-Arg  90.24 
 
 		 79 bp  50.1  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.998646  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0042  tRNA-Arg  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000000705596  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  90.24 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.578717  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0016  tRNA-Arg  90.24 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.625219  normal  0.104037 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0015  tRNA-Arg  90.24 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000291538  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2039  tRNA-Arg  90.24 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000000359807  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0029  tRNA-Arg  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0015  tRNA-Arg  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0299622  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1760  tRNA-Arg  90.24 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1682  tRNA-Arg  90 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.788721  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0010  tRNA-Arg  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00272468  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2213  tRNA-Arg  90 
 
 		 79 bp  48.1  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.140545  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2138  tRNA-Arg  90 
 
 		 79 bp  48.1  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0224464  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0003  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.79204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0016  tRNA-Arg  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000516971  normal  0.0942255 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0048  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0043  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0022  tRNA-Arg  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193997 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0771  tRNA-Arg  100 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19600  tRNA-Arg  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0108959  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0042  tRNA-Arg  90.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0052  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.280732  normal  0.142339 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2224  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000681563  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t63  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 69 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.198832 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t27  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0226872  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA53  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0224894  normal  0.311657 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R67  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0322205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0009  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0189312  normal  0.600027 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2520  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00150959  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2523  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000187168  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2531  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000000138552  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2622  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.130874  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0059  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0741541  normal  0.518093 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2227  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000134564  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2235  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000178277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2308  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00164711  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20500  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0314727  normal  0.242417 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0046  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00661721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1762  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.443699  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1416  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0077  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.749348  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>