198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_R0003 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_R0003  tRNA-Arg  100 
 
 		 78 bp  155  2e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.79204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0012  tRNA-Arg  94.87 
 
 		 78 bp  123  6e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0001  tRNA-Arg  94.94 
 
 		 79 bp  117  3.9999999999999997e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.651067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_7  tRNA-Arg  100 
 
 		 94 bp  115  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.010437 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0025  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 78 bp  107  4e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.954082 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0036  tRNA-Arg  92.11 
 
 		 78 bp  103  6e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.633015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0034  tRNA-Arg  91.03 
 
 		 78 bp  99.6  9e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0034  tRNA-Lys  91.03 
 
 		 78 bp  99.6  9e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0021  tRNA-Lys  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  6e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.360576 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0008  tRNA-Lys  89.74 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0194876  normal  0.882608 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0033  tRNA-OTHER  100 
 
 		 98 bp  91.7  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_3  tRNA-Arg  94.83 
 
 		 94 bp  91.7  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_6  tRNA-Arg  94.83 
 
 		 94 bp  91.7  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0027  tRNA-Lys  91.03 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.968088 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0027  tRNA-Arg  90.91 
 
 		 79 bp  89.7  9e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00420774  hitchhiker  0.0000150687 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0005  tRNA-OTHER  97.87 
 
 		 98 bp  85.7  0.000000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_4  tRNA-Lys  91.53 
 
 		 94 bp  77.8  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0532674 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0040  tRNA-Arg  87.18 
 
 		 78 bp  75.8  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.661464  hitchhiker  0.0000879928 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_0  tRNA-Arg  91.38 
 
 		 94 bp  75.8  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0024  tRNA-OTHER  95.45 
 
 		 98 bp  71.9  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0359457 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0001  tRNA-Arg  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0024  tRNA-OTHER  93.62 
 
 		 101 bp  69.9  0.00000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0031  tRNA-Arg  90.48 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000138998  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0013  tRNA-OTHER  97.44 
 
 		 101 bp  69.9  0.00000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0021  tRNA-Arg  85.9 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.875994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_10  tRNA-Lys  91.38 
 
 		 93 bp  67.9  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_8  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 94 bp  67.9  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0040  tRNA-Arg  87.01 
 
 		 79 bp  65.9  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0001  tRNA-OTHER  97.3 
 
 		 98 bp  65.9  0.000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0811775 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0046  tRNA-Arg  91.07 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.497461 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0001  tRNA-Arg  86.11 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0028  tRNA-OTHER  97.22 
 
 		 95 bp  63.9  0.000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000246213 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0037  tRNA-Arg  92.16 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.462586  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0045  tRNA-Arg  88.14 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.249789 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0046  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.712276  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0015  tRNA-Arg  88.06 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000291538  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0032  tRNA-Arg  88.71 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.151331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0048  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0028  tRNA-Arg  91.49 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221183 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0048  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  87.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0034  tRNA-Arg  88.71 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tArg04  tRNA-Arg  88.71 
 
 		 80 bp  60  0.00000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0364203  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0049  tRNA-Arg  88.71 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000247527  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0091  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000000502507  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0026  tRNA-Lys  94.59 
 
 		 101 bp  58  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.371557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0026  tRNA-OTHER  94.59 
 
 		 101 bp  58  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0101  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0027  tRNA-Arg  89.47 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000775321  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0030  tRNA-Arg  94.59 
 
 		 88 bp  58  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.760789 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0040  tRNA-Arg  89.58 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0050  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0016  tRNA-Arg  92.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.625219  normal  0.104037 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0048  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.195029  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0050  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0048  tRNA-Arg  89.29 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.759858 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0015  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000519668  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0844  tRNA-Arg  92.5 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.998646  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  93.02 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.578717  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0013  tRNA-Arg  89.09 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.473005 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0055  tRNA-Arg  89.36 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000044342  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0017  tRNA-Arg  89.09 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0047  tRNA-Lys  85.33 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.271132  normal  0.595667 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0027  tRNA-Arg  89.09 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0953414  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0770  tRNA-Arg  91.49 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.595906  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1760  tRNA-Arg  93.02 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1467  tRNA-Arg  93.02 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0036  tRNA-OTHER  94.29 
 
 		 99 bp  54  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0029  tRNA-Arg  90.2 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00115694  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0084  tRNA-Arg  88.14 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000200461  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2039  tRNA-Arg  93.02 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000000359807  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0020  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 91 bp  54  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0050  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.581658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0045  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0056  tRNA-Arg  87.1 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000671008  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0026  tRNA-Arg  94.74 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000798043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0019  tRNA-Arg  85.71 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0043  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.478862  hitchhiker  0.000308471 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2520  tRNA-Arg  87.93 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00150959  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2523  tRNA-Arg  87.93 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000187168  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2531  tRNA-Arg  87.93 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000000138552  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2622  tRNA-Arg  87.93 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.130874  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2224  tRNA-Arg  87.93 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000681563  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2227  tRNA-Arg  87.93 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000134564  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2235  tRNA-Arg  87.93 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000178277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2308  tRNA-Arg  87.93 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00164711  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0052  tRNA-Arg  87.1 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000000819113  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0011  tRNA-OTHER  94.12 
 
 		 119 bp  52  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0043  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315798 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0043  tRNA-Thr  91.89 
 
 		 90 bp  50.1  0.00007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2213  tRNA-Arg  92.68 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.140545  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2138  tRNA-Arg  92.68 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0224464  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4261  tRNA-Arg  93.94 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000175716  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1282  tRNA-Arg  93.94 
 
 		 79 bp  50.1  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000513688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0040  tRNA-Arg  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.435782  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0038  tRNA-Arg  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00706583  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0055  tRNA-Arg  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000183529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1682  tRNA-Arg  92.68 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.788721  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0025  tRNA-Arg  94.59 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0037  tRNA-Asn  85.25 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>