35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCAL_0 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  PCAL_0  tRNA-Arg  100 
 
 		 94 bp  186  6e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_8  tRNA-Arg  95.7 
 
 		 94 bp  153  8.999999999999999e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_6  tRNA-Arg  94.62 
 
 		 94 bp  145  2e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_7  tRNA-Arg  92.47 
 
 		 94 bp  129  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.010437 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_3  tRNA-Arg  92.47 
 
 		 94 bp  129  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0036  tRNA-Arg  98.25 
 
 		 78 bp  105  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.633015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_4  tRNA-Lys  88.04 
 
 		 94 bp  95.6  2e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0532674 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0034  tRNA-Arg  94.83 
 
 		 78 bp  91.7  3e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0040  tRNA-Arg  94.83 
 
 		 78 bp  91.7  3e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.661464  hitchhiker  0.0000879928 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0021  tRNA-Arg  97.87 
 
 		 78 bp  85.7  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.875994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_10  tRNA-Lys  94.34 
 
 		 93 bp  81.8  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0003  tRNA-Arg  91.38 
 
 		 78 bp  75.8  0.000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.79204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0025  tRNA-Arg  91.23 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.954082 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0012  tRNA-Arg  91.23 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0021  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.360576 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0034  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 78 bp  58  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0024  tRNA-OTHER  96.77 
 
 		 101 bp  54  0.000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0024  tRNA-OTHER  96.77 
 
 		 98 bp  54  0.000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0359457 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0013  tRNA-OTHER  96.77 
 
 		 101 bp  54  0.000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0001  tRNA-Arg  92.31 
 
 		 79 bp  54  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.651067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0017  tRNA-Arg  91.3 
 
 		 101 bp  52  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0042  tRNA-Arg  90.24 
 
 		 75 bp  50.1  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0050  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 74 bp  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0001  tRNA-OTHER  96.43 
 
 		 98 bp  48.1  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0811775 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0040  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 79 bp  48.1  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0050  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 74 bp  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0048  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 77 bp  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.759858 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0024  tRNA-Arg  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0028  tRNA-OTHER  96.43 
 
 		 95 bp  48.1  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000246213 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0048  tRNA-Arg  87.5 
 
 		 74 bp  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.195029  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0026  tRNA-OTHER  93.55 
 
 		 101 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0026  tRNA-Lys  93.55 
 
 		 101 bp  46.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.371557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0037  tRNA-Val  96.3 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0006  tRNA-Met  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0959756 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0030  tRNA-Arg  91.18 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.760789 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>