29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCAL_4 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  PCAL_4  tRNA-Lys  100 
 
 		 94 bp  186  6e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0532674 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_10  tRNA-Lys  95.65 
 
 		 93 bp  143  9e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_3  tRNA-Arg  91.3 
 
 		 94 bp  119  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0034  tRNA-Lys  100 
 
 		 78 bp  115  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0021  tRNA-Lys  98.28 
 
 		 75 bp  107  5e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.360576 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_0  tRNA-Arg  88.04 
 
 		 94 bp  95.6  2e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_7  tRNA-Arg  88.04 
 
 		 94 bp  95.6  2e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.010437 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0027  tRNA-Lys  94.83 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.968088 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_6  tRNA-Arg  85.87 
 
 		 94 bp  79.8  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_8  tRNA-Arg  94.23 
 
 		 94 bp  79.8  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0008  tRNA-Lys  91.53 
 
 		 78 bp  77.8  0.0000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0194876  normal  0.882608 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0037  tRNA-Asn  92.73 
 
 		 78 bp  77.8  0.0000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0003  tRNA-Arg  91.53 
 
 		 78 bp  77.8  0.0000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.79204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_5  tRNA-Asn  95.35 
 
 		 111 bp  69.9  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0012  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0036  tRNA-Arg  89.66 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.633015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0026  tRNA-OTHER  100 
 
 		 101 bp  63.9  0.000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0012  tRNA-Lys  93.75 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.711012  normal  0.109612 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0026  tRNA-Lys  100 
 
 		 101 bp  63.9  0.000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.371557  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0010  tRNA-Lys  95.24 
 
 		 97 bp  60  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0023  tRNA-OTHER  100 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0046836 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0001  tRNA-Arg  88.33 
 
 		 79 bp  56  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.651067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0035  tRNA-Asn  89.09 
 
 		 77 bp  54  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0033  tRNA-OTHER  93.75 
 
 		 98 bp  48.1  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0005  tRNA-OTHER  93.75 
 
 		 98 bp  48.1  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0036  tRNA-OTHER  94.29 
 
 		 99 bp  46.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0045  tRNA-Arg  86.27 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.249789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0060  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 76 bp  44.1  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.260186  normal  0.112071 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0025  tRNA-Arg  84.48 
 
 		 78 bp  44.1  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.954082 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>