36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_R0017 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_R0017  tRNA-Arg  100 
 
 		 101 bp  200  5e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0033  tRNA-Arg  100 
 
 		 96 bp  75.8  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0024  tRNA-OTHER  100 
 
 		 97 bp  65.9  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0031  tRNA-OTHER  100 
 
 		 97 bp  65.9  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000256784  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0034  tRNA-Arg  91.49 
 
 		 78 bp  54  0.000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0021  tRNA-Arg  91.49 
 
 		 78 bp  54  0.000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.875994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0040  tRNA-Arg  91.49 
 
 		 78 bp  54  0.000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.661464  hitchhiker  0.0000879928 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0043  tRNA-Val  100 
 
 		 94 bp  52  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0030  tRNA-Val  100 
 
 		 94 bp  52  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.961249  hitchhiker  0.000190241 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_8  tRNA-Arg  91.3 
 
 		 94 bp  52  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  PCAL_0  tRNA-Arg  91.3 
 
 		 94 bp  52  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0031  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0027  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 99 bp  50.1  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0042  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  48.1  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0002  tRNA-OTHER  96.3 
 
 		 101 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.32778 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0008  tRNA-OTHER  96.3 
 
 		 130 bp  46.1  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.164432  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0009  tRNA-Val  96.3 
 
 		 93 bp  46.1  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0003  tRNA-OTHER  96.3 
 
 		 112 bp  46.1  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0030  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 106 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0625472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0042  tRNA-Met  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.935118  normal  0.310323 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0040  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 79 bp  46.1  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0036  tRNA-Arg  89.36 
 
 		 78 bp  46.1  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.633015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0035  tRNA-Asn  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0027  tRNA-Arg  96.3 
 
 		 79 bp  46.1  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00420774  hitchhiker  0.0000150687 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0024  tRNA-Ile  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0009  tRNA-Val  96.3 
 
 		 72 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.257244  normal  0.321857 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0037  tRNA-Val  96.3 
 
 		 90 bp  46.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0026  tRNA-OTHER  96.15 
 
 		 118 bp  44.1  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.196712 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0032  tRNA-Tyr  96.15 
 
 		 117 bp  44.1  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0460095  normal  0.912485 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0017  tRNA-Pro  100 
 
 		 108 bp  44.1  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00176898 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0006  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.884692  hitchhiker  0.000380768 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0032  tRNA-Arg  93.33 
 
 		 78 bp  44.1  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.341062 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0019  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.130187 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0026  tRNA-OTHER  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.981984 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0045  tRNA-Val  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0010  tRNA-OTHER  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>