37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_R0043 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_R0043  tRNA-Val  100 
 
 		 94 bp  186  6e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0045  tRNA-Val  89.36 
 
 		 92 bp  87.7  4e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0030  tRNA-Val  87.37 
 
 		 94 bp  77.8  0.0000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.961249  hitchhiker  0.000190241 
 
 
-
 
NC_009954  CMAQ_1  tRNA-OTHER  100 
 
 		 70 bp  58  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0889822 
 
 
-
 
NC_009954  CMAQ_2  tRNA-OTHER  100 
 
 		 73 bp  58  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0010  tRNA-OTHER  94.44 
 
 		 92 bp  56  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0010  tRNA-Ala  100 
 
 		 77 bp  56  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.51045  hitchhiker  0.0091927 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0005  tRNA-OTHER  100 
 
 		 75 bp  56  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.686297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0026  tRNA-OTHER  94.44 
 
 		 92 bp  56  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.981984 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0003  tRNA-OTHER  96.67 
 
 		 112 bp  52  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0017  tRNA-Arg  100 
 
 		 101 bp  52  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0033  tRNA-Arg  100 
 
 		 96 bp  52  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0017  tRNA-Pro  96.67 
 
 		 108 bp  52  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00176898 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0002  tRNA-OTHER  94.12 
 
 		 101 bp  52  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.32778 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0024  tRNA-Ile  94.12 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0019  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.130187 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0009  tRNA-Val  91.89 
 
 		 93 bp  50.1  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0037  tRNA-OTHER  91.67 
 
 		 92 bp  48.1  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0038  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 100 bp  48.1  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00000044076  normal  0.0293745 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0033  tRNA-Val  94.29 
 
 		 98 bp  48.1  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0009  tRNA-Val  91.67 
 
 		 72 bp  48.1  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.257244  normal  0.321857 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0031  tRNA-Arg  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0008  tRNA-OTHER  96.43 
 
 		 130 bp  48.1  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.164432  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0037  tRNA-Val  91.67 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0042  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0030  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 106 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0625472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0042  tRNA-Met  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.935118  normal  0.310323 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0009  tRNA-Val  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0042  tRNA-Val  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0004  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 94 bp  44.1  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0035  tRNA-Asn  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0020  tRNA-OTHER  93.33 
 
 		 126 bp  44.1  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.148409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0018  tRNA-Pro  93.33 
 
 		 101 bp  44.1  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0040  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 78 bp  44.1  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.661464  hitchhiker  0.0000879928 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0013  tRNA-OTHER  90 
 
 		 116 bp  44.1  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.689744 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0006  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.884692  hitchhiker  0.000380768 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0008  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 78 bp  44.1  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000049005  hitchhiker  0.000183919 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>