55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_R0008 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_R0008  tRNA-Gly  100 
 
 		 78 bp  155  2e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000049005  hitchhiker  0.000183919 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0031  tRNA-Gly  94.74 
 
 		 78 bp  119  9.999999999999999e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.285038  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0032  tRNA-Gly  90.79 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.998395  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0025  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0038  tRNA-Gly  88.31 
 
 		 79 bp  73.8  0.000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000426137 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0044  tRNA-Val  88.52 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.305609  normal  0.930599 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0028  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0020  tRNA-Arg  92.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0039  tRNA-Val  84.85 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0015  tRNA-OTHER  92.11 
 
 		 81 bp  52  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.321152 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0029  tRNA-Gly  85.51 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.320757 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0026  tRNA-Gly  93.75 
 
 		 97 bp  48.1  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0014  tRNA-Phe  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0656754 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0018  tRNA-Pro  100 
 
 		 91 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.266454 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0026  tRNA-OTHER  100 
 
 		 92 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.981984 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0010  tRNA-OTHER  100 
 
 		 92 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0008  tRNA-Pro  100 
 
 		 115 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.122607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0019  tRNA-Pro  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.130187 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0037  tRNA-Gly  93.75 
 
 		 97 bp  48.1  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0018  tRNA-Pro  100 
 
 		 101 bp  48.1  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0020  tRNA-OTHER  100 
 
 		 126 bp  48.1  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.148409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0038  tRNA-Pro  100 
 
 		 100 bp  48.1  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00000044076  normal  0.0293745 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0040  tRNA-Phe  96.3 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.738588 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0024  tRNA-Phe  96.3 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0011  tRNA-Gly  96.3 
 
 		 95 bp  46.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0005  tRNA-Phe  96.3 
 
 		 93 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0043  tRNA-Val  96.15 
 
 		 94 bp  44.1  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0040  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0048  tRNA-Pro  100 
 
 		 97 bp  44.1  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0023  tRNA-Pro  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0026  tRNA-OTHER  100 
 
 		 118 bp  44.1  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.196712 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0030  tRNA-Val  96.15 
 
 		 94 bp  44.1  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.961249  hitchhiker  0.000190241 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0042  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.935118  normal  0.310323 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0032  tRNA-Arg  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.341062 
 
 
-
 
NC_010525  TNEU_0  tRNA-OTHER  100 
 
 		 117 bp  44.1  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0003  tRNA-OTHER  100 
 
 		 112 bp  44.1  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0009  tRNA-Val  100 
 
 		 93 bp  44.1  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0027  tRNA-OTHER  100 
 
 		 112 bp  44.1  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0033  tRNA-OTHER  100 
 
 		 109 bp  44.1  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0021  tRNA-Arg  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0002  tRNA-Thr  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00458741  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0008  tRNA-OTHER  100 
 
 		 130 bp  44.1  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.164432  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0020  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 94 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000277692 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0028  tRNA-Pro  100 
 
 		 100 bp  44.1  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0006  tRNA-Gly  100 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.138313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0037  tRNA-Asn  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0014  tRNA-OTHER  100 
 
 		 80 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0030  tRNA-Pro  100 
 
 		 106 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0625472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0024  tRNA-Ile  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0032  tRNA-Tyr  100 
 
 		 117 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0460095  normal  0.912485 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0037  tRNA-Val  100 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0009  tRNA-Val  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.257244  normal  0.321857 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0002  tRNA-OTHER  100 
 
 		 101 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.32778 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0040  tRNA-Arg  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.661464  hitchhiker  0.0000879928 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0021  tRNA-Ala  100 
 
 		 94 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>