11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_R0005 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_R0005  tRNA-OTHER  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.686297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0010  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.51045  hitchhiker  0.0091927 
 
 
-
 
NC_009954  CMAQ_1  tRNA-OTHER  100 
 
 		 70 bp  58  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0889822 
 
 
-
 
NC_009954  CMAQ_2  tRNA-OTHER  100 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0022  tRNA-Ala  89.58 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0112576 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0036  tRNA-Ala  89.58 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0030  tRNA-Val  100 
 
 		 94 bp  56  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.961249  hitchhiker  0.000190241 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0043  tRNA-Val  100 
 
 		 94 bp  56  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0025  tRNA-Ala  89.58 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.65986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0045  tRNA-Val  96.43 
 
 		 92 bp  48.1  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0017  tRNA-Pro  100 
 
 		 108 bp  44.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00176898 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>