11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_R0005 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_R0005  tRNA-OTHER  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.686297  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0010  tRNA-Ala  93.55 
 
 
77 bp  91.7  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.51045  hitchhiker  0.0091927 
 
 
-
 
NC_009954  CMAQ_1  tRNA-OTHER  100 
 
 
70 bp  58  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0889822 
 
 
-
 
NC_009954  CMAQ_2  tRNA-OTHER  100 
 
 
73 bp  58  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0022  tRNA-Ala  89.58 
 
 
72 bp  56  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0112576 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0036  tRNA-Ala  89.58 
 
 
75 bp  56  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0030  tRNA-Val  100 
 
 
94 bp  56  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.961249  hitchhiker  0.000190241 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0043  tRNA-Val  100 
 
 
94 bp  56  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0025  tRNA-Ala  89.58 
 
 
72 bp  56  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.65986  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0045  tRNA-Val  96.43 
 
 
92 bp  48.1  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0017  tRNA-Pro  100 
 
 
108 bp  44.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00176898 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>