33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_R0017 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_R0017  tRNA-Pro  100 
 
 		 108 bp  214  2.9999999999999995e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00176898 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0038  tRNA-Pro  100 
 
 		 100 bp  77.8  0.0000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00000044076  normal  0.0293745 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0018  tRNA-Pro  100 
 
 		 91 bp  77.8  0.0000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.266454 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0008  tRNA-Pro  97.22 
 
 		 115 bp  63.9  0.000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.122607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0020  tRNA-OTHER  97.06 
 
 		 126 bp  60  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.148409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0018  tRNA-Pro  97.06 
 
 		 101 bp  60  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0045  tRNA-Pro  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0562636  normal  0.0295646 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0035  tRNA-Pro  100 
 
 		 91 bp  58  0.0000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0032  tRNA-Gly  96.88 
 
 		 76 bp  56  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.998395  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0025  tRNA-Gly  96.88 
 
 		 76 bp  56  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0028  tRNA-Pro  92.31 
 
 		 100 bp  54  0.000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0042  tRNA-Arg  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0030  tRNA-Val  96.67 
 
 		 94 bp  52  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.961249  hitchhiker  0.000190241 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0043  tRNA-Val  96.67 
 
 		 94 bp  52  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0027  tRNA-OTHER  96.67 
 
 		 112 bp  52  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0026  tRNA-OTHER  91.89 
 
 		 92 bp  50.1  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.981984 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0010  tRNA-OTHER  91.89 
 
 		 92 bp  50.1  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0048  tRNA-Pro  92.5 
 
 		 97 bp  48.1  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0004  tRNA-Thr  91.43 
 
 		 94 bp  46.1  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0009  tRNA-Val  91.43 
 
 		 93 bp  46.1  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0019  tRNA-Pro  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.130187 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0035  tRNA-Asn  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0033  tRNA-OTHER  89.47 
 
 		 109 bp  44.1  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0031  tRNA-Arg  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  CMAQ_2  tRNA-OTHER  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0010  tRNA-Ala  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.51045  hitchhiker  0.0091927 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0005  tRNA-OTHER  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.686297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0033  tRNA-Arg  100 
 
 		 96 bp  44.1  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  CMAQ_1  tRNA-OTHER  100 
 
 		 70 bp  44.1  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0889822 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0008  tRNA-OTHER  93.33 
 
 		 130 bp  44.1  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.164432  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0014  tRNA-Phe  93.33 
 
 		 75 bp  44.1  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0656754 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0014  tRNA-OTHER  89.47 
 
 		 80 bp  44.1  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0017  tRNA-Arg  100 
 
 		 101 bp  44.1  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>