68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_R0004 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_R0004  tRNA-Thr  100 
 
 		 94 bp  186  6e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0022  tRNA-OTHER  95 
 
 		 130 bp  63.9  0.000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0026  tRNA-OTHER  93.02 
 
 		 92 bp  61.9  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.981984 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0010  tRNA-OTHER  93.02 
 
 		 92 bp  61.9  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0025  tRNA-OTHER  100 
 
 		 122 bp  60  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0033  tRNA-Val  96.88 
 
 		 98 bp  56  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0013  tRNA-OTHER  100 
 
 		 116 bp  54  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.689744 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0010  tRNA-OTHER  100 
 
 		 117 bp  54  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0009  tRNA-OTHER  100 
 
 		 119 bp  54  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0048  tRNA-Ser  94.29 
 
 		 95 bp  54  0.000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0037  tRNA-OTHER  100 
 
 		 92 bp  54  0.000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0009  tRNA-Val  94.29 
 
 		 93 bp  54  0.000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0019  tRNA-Pro  96.77 
 
 		 76 bp  54  0.000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.130187 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0020  tRNA-OTHER  94.12 
 
 		 126 bp  52  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.148409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0018  tRNA-Lys  96.67 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.29875 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0018  tRNA-Pro  94.12 
 
 		 101 bp  52  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0024  tRNA-OTHER  100 
 
 		 97 bp  52  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0008  tRNA-OTHER  96.67 
 
 		 130 bp  52  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.164432  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0038  tRNA-Arg  100 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.91696  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0010  tRNA-Lys  100 
 
 		 97 bp  52  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0011  tRNA-Lys  100 
 
 		 96 bp  52  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.935376  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  ABOO_t20  tRNA-Arg  100 
 
 		 124 bp  50.1  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0045  tRNA-Val  96.55 
 
 		 92 bp  50.1  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0004  tRNA-OTHER  100 
 
 		 117 bp  50.1  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00000377684  decreased coverage  0.000000420741 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0012  tRNA-Lys  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.711012  normal  0.109612 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0022  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  50.1  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.805604 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0004  tRNA-OTHER  100 
 
 		 115 bp  50.1  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0038  tRNA-Pro  93.94 
 
 		 100 bp  50.1  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00000044076  normal  0.0293745 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0004  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  50.1  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0464601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0025  tRNA-OTHER  100 
 
 		 128 bp  50.1  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0008  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 115 bp  48.1  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.122607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0005  tRNA-Arg  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00128122  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0009  tRNA-Val  93.75 
 
 		 72 bp  48.1  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.257244  normal  0.321857 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0042  tRNA-OTHER  93.75 
 
 		 96 bp  48.1  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.36333 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0018  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 91 bp  48.1  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.266454 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0037  tRNA-Val  93.75 
 
 		 90 bp  48.1  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0015  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.794494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0003  tRNA-OTHER  96.43 
 
 		 112 bp  48.1  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0036  tRNA-Ala  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0017  tRNA-Pro  91.43 
 
 		 108 bp  46.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00176898 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0025  tRNA-Gly  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0042  tRNA-Met  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.935118  normal  0.310323 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0031  tRNA-Gly  100 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0032  tRNA-Gly  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.998395  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0020  tRNA-Gly  100 
 
 		 94 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000277692 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_R0025  tRNA-OTHER  100 
 
 		 108 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0002  tRNA-OTHER  96.3 
 
 		 101 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.32778 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0029  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.320757 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0015  tRNA-Gly  100 
 
 		 91 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.123591 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0030  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 106 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0625472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0024  tRNA-Ile  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0031  tRNA-OTHER  96.15 
 
 		 97 bp  44.1  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000256784  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0040  tRNA-Arg  96.15 
 
 		 78 bp  44.1  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.661464  hitchhiker  0.0000879928 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0011  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.759432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0027  tRNA-Arg  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0005  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 104 bp  44.1  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.892515  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0027  tRNA-OTHER  93.33 
 
 		 112 bp  44.1  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0025  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.65986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0020  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 98 bp  44.1  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.06804  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0028  tRNA-Pro  91.18 
 
 		 100 bp  44.1  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0036  tRNA-OTHER  93.33 
 
 		 108 bp  44.1  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0043  tRNA-Val  93.33 
 
 		 94 bp  44.1  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0030  tRNA-Val  93.33 
 
 		 94 bp  44.1  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.961249  hitchhiker  0.000190241 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0026  tRNA-OTHER  93.33 
 
 		 118 bp  44.1  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.196712 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0011  tRNA-Lys  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.597618  normal  0.106894 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0023  tRNA-OTHER  100 
 
 		 116 bp  44.1  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0046836 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0022  tRNA-Ala  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0112576 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0020  tRNA-OTHER  96.15 
 
 		 122 bp  44.1  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.430944  hitchhiker  0.000000157514 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>