32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_R0045 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_R0045  tRNA-Val  100 
 
 
92 bp  182  1e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0043  tRNA-Val  89.36 
 
 
94 bp  87.7  4e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0030  tRNA-Val  97.14 
 
 
94 bp  61.9  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.961249  hitchhiker  0.000190241 
 
 
-
 
NC_009954  CMAQ_2  tRNA-OTHER  96.55 
 
 
73 bp  50.1  0.00009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0042  tRNA-OTHER  96.55 
 
 
96 bp  50.1  0.00009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.36333 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0004  tRNA-Thr  96.55 
 
 
94 bp  50.1  0.00009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  CMAQ_1  tRNA-OTHER  96.55 
 
 
70 bp  50.1  0.00009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0889822 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0015  tRNA-Ala  96.55 
 
 
75 bp  50.1  0.00009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.794494  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0033  tRNA-Val  91.89 
 
 
98 bp  50.1  0.00009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0011  tRNA-Ala  96.55 
 
 
72 bp  50.1  0.00009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.759432  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0022  tRNA-Ala  96.43 
 
 
72 bp  48.1  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0112576 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0005  tRNA-OTHER  96.43 
 
 
75 bp  48.1  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.686297  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0010  tRNA-Ala  96.43 
 
 
77 bp  48.1  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.51045  hitchhiker  0.0091927 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0036  tRNA-Ala  96.43 
 
 
75 bp  48.1  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0026  tRNA-OTHER  91.67 
 
 
92 bp  48.1  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.981984 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_R0010  tRNA-OTHER  91.67 
 
 
92 bp  48.1  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0025  tRNA-Ala  96.43 
 
 
72 bp  48.1  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.65986  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0009  tRNA-Val  88.37 
 
 
93 bp  46.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0025  tRNA-OTHER  96.3 
 
 
122 bp  46.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0022  tRNA-OTHER  96.3 
 
 
130 bp  46.1  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0038  tRNA-Arg  96.15 
 
 
74 bp  44.1  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.91696  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0009  tRNA-Val  96.15 
 
 
75 bp  44.1  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0042  tRNA-Val  93.33 
 
 
75 bp  44.1  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0019  tRNA-Pro  96.67 
 
 
76 bp  44.1  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.130187 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0024  tRNA-Ile  91.18 
 
 
75 bp  44.1  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0002  tRNA-OTHER  91.18 
 
 
101 bp  44.1  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.32778 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0033  tRNA-Arg  96.15 
 
 
96 bp  44.1  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0031  tRNA-OTHER  96.15 
 
 
97 bp  44.1  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.000256784  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0024  tRNA-OTHER  96.15 
 
 
97 bp  44.1  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0017  tRNA-Arg  96.15 
 
 
101 bp  44.1  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0011  tRNA-Lys  96.15 
 
 
96 bp  44.1  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.935376  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0010  tRNA-Lys  96.15 
 
 
97 bp  44.1  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>