18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_R0009 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_R0009  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0019  tRNA-Val  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0042  tRNA-Val  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.233202 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0039  tRNA-Val  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0006  tRNA-Val  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.642038 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0058  tRNA-Val  86.67 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.729996  normal  0.0975699 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0026  tRNA-Val  92 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0528706  normal  0.284457 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0013  tRNA-Val  92.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.237291 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0034  tRNA-Val  85.96 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0034  tRNA-Val  88.24 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0044  tRNA-Val  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.305609  normal  0.930599 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0009  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.488573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0014  tRNA-Val  96.3 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190864  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0026  tRNA-Glu  89.36 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0391108  normal  0.06286 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0003  tRNA-Val  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.892516 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0030  tRNA-Val  93.33 
 
 		 94 bp  44.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.961249  hitchhiker  0.000190241 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0043  tRNA-Val  96.15 
 
 		 94 bp  44.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0045  tRNA-Val  96.15 
 
 		 92 bp  44.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>