9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_R0044 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_R0044  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.305609  normal  0.930599 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0039  tRNA-Val  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0031  tRNA-Gly  91.8 
 
 		 78 bp  81.8  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.285038  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0019  tRNA-Val  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0008  tRNA-Gly  88.52 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000049005  hitchhiker  0.000183919 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0042  tRNA-Val  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0013  tRNA-Val  87.1 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.237291 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0009  tRNA-Val  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0030  tRNA-Val  96.15 
 
 		 94 bp  44.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.961249  hitchhiker  0.000190241 
 
 
-
 
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