25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_R0019 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_R0019  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0042  tRNA-Val  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.233202 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0009  tRNA-Val  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0039  tRNA-Val  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0044  tRNA-Val  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.305609  normal  0.930599 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0013  tRNA-Val  90.32 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.237291 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0034  tRNA-Val  89.47 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0061  tRNA-Val  89.47 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.052362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0064  tRNA-Val  89.47 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.051459  normal  0.742541 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0058  tRNA-Val  88.14 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.729996  normal  0.0975699 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0014  tRNA-Val  86.67 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.959963  normal  0.776382 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0044  tRNA-Val  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0042  tRNA-Val  90.2 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_R0006  tRNA-Val  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.642038 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0023  tRNA-Val  85.33 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.494525  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0056  tRNA-Val  89.36 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000959605  hitchhiker  0.0000412261 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0024  tRNA-Ile  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0002  tRNA-OTHER  93.75 
 
 		 101 bp  48.1  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.32778 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0022  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000414073  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0038  tRNA-Gly  85.07 
 
 		 79 bp  46.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000426137 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0008  tRNA-Val  86.27 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0028  tRNA-Gly  85.07 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0051  tRNA-Val  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0030  tRNA-Val  96.15 
 
 		 94 bp  44.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.961249  hitchhiker  0.000190241 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0042  tRNA-Met  93.33 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.935118  normal  0.310323 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>