28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_R0023 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_R0023  tRNA-Val  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.494525  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0015  tRNA-Val  91.89 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0118256  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0026  tRNA-Val  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0528706  normal  0.284457 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0034  tRNA-Val  89.19 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0014  tRNA-Val  86.76 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190864  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0014  tRNA-Val  90 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.959963  normal  0.776382 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0012  tRNA-Val  88.89 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.55477 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0019  tRNA-Val  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0011  tRNA-Val  85.07 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.592094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0001  tRNA-Val  100 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0010  tRNA-Val  86.21 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.41127  normal  0.578821 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0044  tRNA-Val  88 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0051  tRNA-Val  85.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0010  tRNA-Val  85.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0233466  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0007  tRNA-Val  90.24 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.997885  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0034  tRNA-Val  87.76 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0007  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000136708 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0014  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_013926  ABOO_t65  tRNA-Tyr  100 
 
 		 117 bp  44.1  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000604758  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0050  tRNA-Cys  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0038  tRNA-Gln  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0250632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0035  tRNA-Gln  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0015  tRNA-Val  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.527098  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0062  tRNA-Val  89.47 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.268364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0058  tRNA-Val  86.96 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.729996  normal  0.0975699 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0064  tRNA-Val  86 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.051459  normal  0.742541 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0061  tRNA-Val  86 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.052362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0034  tRNA-Val  86 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>