24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_R0015 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_R0015  tRNA-Val  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0118256  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0023  tRNA-Val  91.89 
 
 
74 bp  91.7  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.494525  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0034  tRNA-Val  87.67 
 
 
73 bp  73.8  0.000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0026  tRNA-Val  85.14 
 
 
74 bp  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0528706  normal  0.284457 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0003  tRNA-Val  100 
 
 
73 bp  52  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.197123  normal  0.950412 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0012  tRNA-Val  84.93 
 
 
72 bp  50.1  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.55477 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0018  tRNA-Val  91.43 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0243467  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0017  tRNA-Val  91.43 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.217131  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0021  tRNA-Val  91.43 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0014  tRNA-Val  96.3 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.190864  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0017  tRNA-Val  91.43 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0043  tRNA-Val  91.43 
 
 
72 bp  46.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0298498  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0050  tRNA-Cys  100 
 
 
72 bp  44.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0035  tRNA-Gln  100 
 
 
73 bp  44.1  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  ABOO_t65  tRNA-Tyr  100 
 
 
117 bp  44.1  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000604758  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0014  tRNA-Pro  96.15 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0007  tRNA-Pro  96.15 
 
 
71 bp  44.1  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.000136708 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0038  tRNA-Gln  100 
 
 
73 bp  44.1  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0250632  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0014  tRNA-Val  88 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.959963  normal  0.776382 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0009  tRNA-Val  89.47 
 
 
93 bp  44.1  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0024  tRNA-Ile  91.18 
 
 
75 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_R0002  tRNA-OTHER  91.18 
 
 
101 bp  44.1  0.005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.32778 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0025  tRNA-OTHER  93.33 
 
 
122 bp  44.1  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0022  tRNA-OTHER  93.33 
 
 
130 bp  44.1  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>