33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_R0014 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_R0014  tRNA-Val  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.959963  normal  0.776382 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0044  tRNA-Val  94.59 
 
 		 77 bp  115  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0058  tRNA-Val  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.729996  normal  0.0975699 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0062  tRNA-Val  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.268364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0042  tRNA-Val  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0056  tRNA-Val  95.24 
 
 		 74 bp  101  2e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000959605  hitchhiker  0.0000412261 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0061  tRNA-Val  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.052362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0064  tRNA-Val  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.051459  normal  0.742541 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0051  tRNA-Val  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0048  tRNA-Val  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00355278  normal  0.78382 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0010  tRNA-Val  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0233466  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0008  tRNA-Val  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0034  tRNA-Val  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0017  tRNA-Val  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.997912  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0015  tRNA-Val  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.527098  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0034  tRNA-Val  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0001  tRNA-Val  95.45 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0003  tRNA-Val  95.35 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.892516 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0026  tRNA-Val  95.35 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0528706  normal  0.284457 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0020  tRNA-Val  93.18 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_R0019  tRNA-Val  86.67 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0023  tRNA-Val  90 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.494525  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0011  tRNA-Val  92.86 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.592094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0050  tRNA-Asp  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0015  tRNA-Asp  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0034  tRNA-Val  96.88 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0007  tRNA-Val  88.64 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.997885  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0060  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000313438  normal  0.60416 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0029  tRNA-Val  89.13 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0047  tRNA-OTHER  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0042  tRNA-OTHER  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00993442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0015  tRNA-Val  88 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0118256  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0060  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00280005  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>