25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_R0029 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_R0029  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0038  tRNA-Val  94.23 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.132032  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0009  tRNA-Val  92.31 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0003  tRNA-Val  85.92 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.197123  normal  0.950412 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_R0053  tRNA-Val  88.46 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.297714  normal  0.2473 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0031  tRNA-Val  85.48 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.213093  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0015  tRNA-Ile  93.55 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.173828  normal  0.314939 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0008  tRNA-Ile  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000696824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0042  tRNA-Ile  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0171814  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0002  tRNA-Ile  93.55 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0024  tRNA-Met  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0052  tRNA-Ile  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000626175  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0044  tRNA-Ile  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0477159  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0037  tRNA-Ile  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000489104  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0011  tRNA-Ile  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00277001  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0048  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.726502  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0036  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000106815  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Met-1  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0018  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0051  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.289296 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0014  tRNA-Val  89.13 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.959963  normal  0.776382 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0048  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0036  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000000382466  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0017  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.655239  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Met-2  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>