24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_R0020 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_R0020  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0014  tRNA-Val  93.18 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.959963  normal  0.776382 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0012  tRNA-Val  93.18 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.55477 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0051  tRNA-Val  93.18 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0008  tRNA-Val  90.16 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0058  tRNA-Val  90.91 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.729996  normal  0.0975699 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0003  tRNA-Val  92.86 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.892516 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0034  tRNA-Val  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0010  tRNA-Val  86.67 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0233466  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0042  tRNA-Val  86.67 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0056  tRNA-Val  86.67 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000959605  hitchhiker  0.0000412261 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0017  tRNA-Val  88.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.997912  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0015  tRNA-Val  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.527098  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0044  tRNA-Val  88.64 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0064  tRNA-Val  88.64 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.051459  normal  0.742541 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0061  tRNA-Val  88.64 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.052362  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0001  tRNA-Val  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0034  tRNA-Val  88.1 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0058  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0053  tRNA-Ala  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000600525 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0004  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0037  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0234109  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30530  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.601239  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>